TCN1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
TCN1编码维生素B12结合蛋白转钴胺素蛋白I,在维生素B12转运和先天免疫中发挥重要作用,其缺乏与维生素B12代谢异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TCN1 |
|---|---|
| 基因全名 | Transcobalamin I |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q12.1 |
| NCBI Gene ID | 6947 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6947 |
| Ensembl ID | ENSG00000134827 |
| UniProt ID | P20061 |
| OMIM ID | 189905 |
| HGNC ID | 11652 |
| 基因别名 | TC-1, TC1, TCI, Transcobalamin I |
基因功能与研究简介
TCN1基因编码转钴胺素蛋白I(Transcobalamin I),也称为R蛋白或结合蛋白,主要在唾液腺、胃黏膜和中性粒细胞中表达。该蛋白与维生素B12(钴胺素)结合,参与其在血浆中的转运和储存。TCN1缺乏可导致维生素B12水平降低,但通常不引起典型的维生素B12缺乏症状,因为其他转运蛋白(如转钴胺素II)可以代偿。TCN1还参与先天免疫,其表达在炎症和感染时可能上调。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 维生素B12转运异常 | TCN1缺乏导致维生素B12结合能力下降,但通常不引起严重缺乏症状,因为转钴胺素II可代偿。 | OMIM |
| 胃癌 | TCN1在胃癌组织中表达上调,可能作为肿瘤标志物,但具体机制尚不明确。 | COSMIC |
| 胰腺癌 | TCN1在胰腺癌中表达升高,可能参与肿瘤进展,但证据有限。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 唾液腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 早幼粒细胞白血病细胞系 |
| K-562 | 暂无可靠数据 | 慢性粒细胞白血病细胞系 |
| MKN-45 | 暂无可靠数据 | 胃癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.76C>T (p.Arg26Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,可能影响维生素B12结合能力。 |
| c.112G>A (p.Gly38Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或结合功能,但临床意义未明。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
TCN1功能缺失突变可能导致维生素B12结合能力下降,但通常由其他转运蛋白代偿,临床表型较轻。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明TCN1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明TCN1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0008144 - drug binding | • GO:0005576 - extracellular region |
| • GO:0005615 - extracellular space | • GO:0031418 - L-ascorbic acid binding |
相关通路
• Vitamin B12 metabolism (Reactome: R-HSA-196741)
• Cobalamin transport (Reactome: R-HSA-196757)
蛋白质功能简介
TCN1蛋白(UniProt P20061)是维生素B12结合蛋白家族成员,主要在唾液腺、胃黏膜和中性粒细胞中合成。该蛋白与维生素B12结合,参与其在血浆中的转运和储存。TCN1蛋白由417个氨基酸组成,包含信号肽和多个糖基化位点。其三维结构尚未完全解析,但已知其与维生素B12结合具有高亲和力。TCN1在炎症和感染时表达上调,可能参与先天免疫应答。
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