TCTN3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TCTN3是编码Tectonic家族蛋白的基因,参与Hedgehog信号通路,其突变与Joubert综合征等纤毛病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TCTN3 |
|---|---|
| 基因全名 | Tectonic family member 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q24.1 |
| NCBI Gene ID | 26145 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26145 |
| Ensembl ID | ENSG00000119977 |
| UniProt ID | Q6NUS6 |
| OMIM ID | 613847 |
| HGNC ID | 24519 |
| 基因别名 | C10orf61, TECT3, FLJ12735 |
基因功能与研究简介
TCTN3基因编码Tectonic家族成员3蛋白,该蛋白定位于初级纤毛的过渡区,是Hedgehog信号通路的负调控因子。TCTN3在胚胎发育中发挥重要作用,其突变可导致多种纤毛病,如Joubert综合征、Meckel综合征等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Joubert综合征 | TCTN3突变导致纤毛功能障碍,影响Hedgehog信号通路,导致小脑蚓部发育不全等 | 已明确致病 |
| Meckel综合征 | TCTN3突变导致纤毛功能障碍,影响胚胎发育,导致多器官畸形 | 已明确致病 |
| 口面指综合征 | TCTN3突变可能影响纤毛功能,导致面部、口腔和手指畸形 | 具有较强研究证据 |
| 肾消耗病 | TCTN3突变可能影响肾纤毛功能,导致肾囊肿和肾功能不全 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| IMR-90 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HUVEC | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.211C>T (p.Arg71Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.742C>T (p.Arg248Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1250G>A (p.Arg417His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致蛋白功能丧失,如无义突变或移码突变,导致蛋白截短或降解。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):突变导致蛋白获得新功能或增强原有功能,目前TCTN3未见明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):突变蛋白干扰正常蛋白功能,目前TCTN3未见明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005929 (cilium) |
| • GO:0036064 (ciliary basal body) | • GO:0042995 (cell projection) |
| • GO:0060271 (cilium assembly) | • GO:0007224 (smoothened signaling pathway) |
相关通路
• Hedgehog signaling pathway (KEGG: hsa04340)
• Cilium assembly (GO:0060271)
蛋白质功能简介
TCTN3蛋白是Tectonic家族成员,定位于初级纤毛的过渡区,参与调控Hedgehog信号通路。该蛋白在胚胎发育中至关重要,其突变可导致纤毛功能障碍,进而引发多种纤毛病。