TDG基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TDG（胸腺嘧啶DNA糖基化酶）是碱基切除修复（BER）通路的关键酶，参与DNA去甲基化和基因组稳定性维持，其功能异常与多种癌症及发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TDG |
|---|---|
| 基因全名 | Thymine-DNA glycosylase |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12q24.1 |
| NCBI Gene ID | 6996 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6996 |
| Ensembl ID | ENSG00000139372 |
| UniProt ID | Q13569 |
| OMIM ID | 601423 |
| HGNC ID | 11700 |
| 基因别名 | hTDG |
基因功能与研究简介
TDG基因编码胸腺嘧啶DNA糖基化酶，是碱基切除修复（BER）通路的关键酶。该酶识别并切除DNA中G:T和G:U错配的胸腺嘧啶或尿嘧啶，启动BER修复过程。此外，TDG还参与活性DNA去甲基化，通过切除5-甲基胞嘧啶氧化衍生物（如5-羧基胞嘧啶）来调控基因表达。TDG在维持基因组稳定性、调控基因表达和细胞分化中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | TDG基因突变或表达异常可能导致BER功能缺陷，增加突变积累，与结直肠癌的发生相关。 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | TDG表达下调与胃癌的进展和预后不良相关。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | TDG多态性可能影响个体对肺癌的易感性。 | 潜在关联 |
| 发育障碍 | TDG功能缺失可能影响DNA去甲基化，导致发育异常，但具体机制尚在研究中。 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 大脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始，导致功能丧失 |
| c.463C>T (p.Arg155Ter) | 无义突变 | 罕见 | 产生截短蛋白，导致功能丧失 |
| c.1045G>A (p.Gly349Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性，导致功能改变 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
功能丧失型突变，如无义突变或移码突变，导致TDG蛋白缺失或截短，丧失DNA糖基化酶活性，影响BER修复和DNA去甲基化。
Gain of Function（功能获得，GOF）
目前暂无明确证据表明TDG存在功能获得型突变。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
目前暂无明确证据表明TDG存在显性负效应突变。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003684 (damaged DNA binding) | • GO:0006284 (base-excision repair) |
| • GO:0008725 (DNA-3-methyladenine glycosylase activity) | • GO:0019104 (DNA N-glycosylase activity) |
| • GO:0035514 (DNA demethylation) | • GO:0005654 (nucleoplasm) |
相关通路
• Base excision repair (hsa03410)
• DNA demethylation (hsa00310)
蛋白质功能简介
TDG蛋白属于DNA糖基化酶家族，包含一个保守的催化结构域，能够识别并切除DNA中的错配碱基。TDG在细胞核中表达，与多种蛋白相互作用，如DNMT3A、GADD45A等，参与DNA去甲基化过程。TDG的活性受细胞周期和DNA损伤信号调控，其功能异常与肿瘤发生密切相关。
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