TDRD9基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TDRD9是参与piRNA通路和转座子沉默的关键蛋白,对精子发生至关重要,其突变与男性不育相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TDRD9 |
|---|---|
| 基因全名 | Tudor domain containing 9 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q32.33 |
| NCBI Gene ID | 122618 ncbi.nlm.nih.gov/gene/122618 |
| Ensembl ID | ENSG00000100599 |
| UniProt ID | Q8NDG6 |
| OMIM ID | 617724 |
| HGNC ID | 26124 |
| 基因别名 | TDRD9, FLJ35641, MGC126851 |
基因功能与研究简介
TDRD9基因编码Tudor结构域蛋白9,属于Tudor家族,参与piRNA介导的转座子沉默和精子发生。TDRD9在睾丸中高表达,其蛋白定位于nuage(生殖颗粒),与piRNA通路蛋白相互作用,对减数分裂和精子成熟至关重要。TDRD9突变可导致非梗阻性无精子症,表现为生精障碍。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 非梗阻性无精子症 | TDRD9突变导致piRNA通路缺陷,转座子激活,生精细胞凋亡,引起无精子症。 | 已明确致病 |
| 男性不育 | TDRD9突变与男性不育相关,但具体机制需进一步研究。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2345A>G (p.Tyr782Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致蛋白截短或降解,丧失piRNA通路功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 (RNA binding) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0031047 (gene silencing by RNA) | • GO:0007286 (spermatid development) |
相关通路
• piRNA metabolic process (GO:0034587)
• Meiotic cell cycle (GO:0051321)
蛋白质功能简介
TDRD9蛋白包含多个Tudor结构域,参与piRNA通路,与PIWIL蛋白相互作用,介导转座子沉默。在精子发生中,TDRD9定位于nuage,对减数分裂和精子成熟至关重要。