TET1基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TET1是DNA去甲基化关键酶，参与基因表达调控，与多种癌症及发育疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TET1 |
|---|---|
| 基因全名 | Tet methylcytosine dioxygenase 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q21.3 |
| NCBI Gene ID | 80312 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80312 |
| Ensembl ID | ENSG00000138336 |
| UniProt ID | Q8NFU7 |
| OMIM ID | 607126 |
| HGNC ID | 29421 |
| 基因别名 | LCX, CXXC6, bA119F7.1 |
基因功能与研究简介
TET1基因编码一种双加氧酶，属于TET蛋白家族，催化5-甲基胞嘧啶（5mC）氧化为5-羟甲基胞嘧啶（5hmC），进而促进DNA去甲基化。TET1在基因启动子区域富集，参与调控基因表达、胚胎发育、干细胞多能性维持等过程。TET1功能异常与多种肿瘤（如白血病、黑色素瘤）及发育疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 急性髓系白血病 | TET1突变或表达下调导致DNA去甲基化异常，影响造血分化，促进白血病发生。 | 已明确致病 |
| 黑色素瘤 | TET1表达降低导致5hmC水平下降，促进肿瘤进展。 | 具有较强研究证据 |
| 胶质瘤 | TET1突变或表达异常与胶质瘤发生相关。 | 具有较强研究证据 |
| 发育迟缓 | TET1功能缺失影响神经发育，可能导致智力障碍。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1123C>T (p.Arg375Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1480A>G (p.Thr494Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响催化活性 |
| c.1900_1901del (p.Leu634ValfsTer3) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
功能缺失突变，导致TET1蛋白截短或催化活性丧失，影响DNA去甲基化。
Gain of Function（功能获得，GOF）
暂无明确证据。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
暂无明确证据。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0005506 iron ion binding |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0008270 zinc ion binding |
| • GO:0016491 oxidoreductase activity | • GO:0031490 chromatin DNA binding |
| • GO:0046872 metal ion binding | • GO:0055114 oxidation-reduction process |
相关通路
• DNA methylation and demethylation (WP4667)
• Epigenetic regulation of gene expression (WP3595)
蛋白质功能简介
TET1蛋白包含CXXC锌指结构域和催化结构域，催化5mC氧化为5hmC，参与DNA去甲基化。TET1在胚胎干细胞中高表达，维持多能性相关基因的表达。在肿瘤中，TET1表达下调或突变导致5hmC水平降低，促进肿瘤发生。
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