TFAP2A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TFAP2A(AP-2α)是调控胚胎发育和细胞分化的关键转录因子,其突变与Branchiooculofacial综合征相关。

基因信息卡

基因符号 TFAP2A
基因全名 Transcription Factor AP-2 Alpha
基因类型 protein-coding
染色体位置 6p24.3
NCBI Gene ID 7020 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7020
Ensembl ID ENSG00000137266
UniProt ID P05549
OMIM ID 107580
HGNC ID 11742
基因别名 AP-2, AP2TF, BOFS, TFAP2

基因功能与研究简介

TFAP2A(Transcription Factor AP-2 Alpha)编码转录因子AP-2α,属于AP-2家族。该蛋白以同源二聚体或异源二聚体形式结合DNA,调控多种基因的表达,参与胚胎发育、细胞分化和凋亡等过程。TFAP2A在神经嵴、颅面发育和肢体形成中发挥关键作用。其突变可导致Branchiooculofacial综合征(BOFS),并可能与多种癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Branchiooculofacial综合征 TFAP2A突变导致单倍剂量不足或显性负效应,影响神经嵴细胞发育,导致颅面、眼和鳃弓异常。 已明确致病
唇腭裂 TFAP2A变异可能增加非综合征性唇腭裂风险,但证据有限。 潜在关联
黑色素瘤 TFAP2A表达下调与黑色素瘤进展和转移相关,可能作为肿瘤抑制因子。 癌症相关
乳腺癌 TFAP2A表达异常与乳腺癌亚型和预后相关,但机制尚不明确。 癌症相关

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 暂无可靠数据
胎盘 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A375 暂无可靠数据 黑色素瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.637C>T (p.Arg213Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,可能引起单倍剂量不足
c.820G>A (p.Glu274Lys) 错义突变 罕见 可能影响DNA结合或二聚化,导致功能丧失
c.1042C>T (p.Arg348Trp) 错义突变 罕见 可能影响转录激活功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变和移码突变导致蛋白截短或降解,使功能丧失,引起单倍剂量不足。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明TFAP2A存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

某些错义突变可能产生干扰正常二聚体功能的蛋白,发挥显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding) • GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity
• RNA polymerase II-specific) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II) • GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II)

相关通路

hsa04550 (Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

TFAP2A编码的AP-2α蛋白包含一个C端螺旋-环-螺旋结构域和一个N端转录激活结构域,以同源或异源二聚体形式结合GC-rich DNA序列。该蛋白在胚胎发育中调控多个基因的表达,影响神经嵴、颅面和肢体形成。在成体中,AP-2α参与细胞增殖和分化调控,其表达异常与多种肿瘤相关。

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