TFPT基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TFPT(TCF3融合伴侣)基因,参与细胞凋亡调控,与B细胞恶性肿瘤相关。

基因信息卡

基因符号 TFPT
基因全名 TCF3 fusion partner
基因类型 protein-coding
染色体位置 19q13.32
NCBI Gene ID 29844 ncbi.nlm.nih.gov/gene/29844
Ensembl ID ENSG00000105656
UniProt ID P0C7T5
OMIM ID 604608
HGNC ID 18139
基因别名 FB1, FLJ22402, MGC138228

基因功能与研究简介

TFPT(TCF3 fusion partner)基因编码一种与TCF3(E2A)融合的蛋白,最初在儿童前B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)中作为t(1;19)易位的融合伴侣被发现。TFPT蛋白含有N端PEST序列和C端富含脯氨酸区域,可能参与凋亡调控。研究表明TFPT在细胞凋亡中发挥抑制作用,其表达下调可促进凋亡。TFPT在多种组织中表达,尤其在脾脏和胸腺中较高。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
B细胞急性淋巴细胞白血病 TFPT与TCF3融合形成致癌蛋白,导致异常转录调控,促进白血病发生。 已明确致病
弥漫大B细胞淋巴瘤 TFPT表达异常可能参与淋巴瘤发生,但具体机制尚不明确。 潜在关联
自身免疫性疾病 TFPT在免疫细胞中表达,可能参与免疫调节,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
脾脏 暂无可靠数据 高表达
胸腺 暂无可靠数据 高表达
外周血白细胞 暂无可靠数据 中等表达
淋巴结 暂无可靠数据 中等表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
REH 暂无可靠数据 B细胞前体白血病细胞系
NALM6 暂无可靠数据 B细胞前体白血病细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
t(1;19)(q23;p13) 染色体易位 罕见 产生TCF3-TFPT融合蛋白,可能具有致癌活性
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能异常
c.100C>T (p.Arg34Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短,可能丧失凋亡抑制功能,促进细胞凋亡。

Gain of Function(功能获得,GOF)

染色体易位产生融合蛋白,可能获得新的致癌功能,促进细胞增殖。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006915 (apoptotic process) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0005515 (protein binding)

相关通路

hsa04210 (Apoptosis)
hsa05202 (Transcriptional misregulation in cancer)

蛋白质功能简介

TFPT蛋白由约200个氨基酸组成,含有N端PEST序列(与蛋白降解相关)和C端富含脯氨酸区域。TFPT在细胞凋亡中起抑制作用,可能通过调节BCL2家族蛋白或caspase活性。TFPT与TCF3融合后,可能干扰TCF3的转录调控功能,导致B细胞分化异常。

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