TGM6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TGM6编码转谷氨酰胺酶6,主要在小脑高表达,其突变与脊髓小脑性共济失调35型相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TGM6 |
|---|---|
| 基因全名 | transglutaminase 6 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 20q13.13 |
| NCBI Gene ID | 57378 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57378 |
| Ensembl ID | ENSG00000130513 |
| UniProt ID | O95932 |
| OMIM ID | 613900 |
| HGNC ID | 11783 |
| 基因别名 | TGM6, TG6, TGM6L |
基因功能与研究简介
TGM6基因编码转谷氨酰胺酶6(TG6),属于转谷氨酰胺酶家族,催化蛋白质交联反应。该基因主要在小脑和中枢神经系统中高表达,参与神经元的发育和功能维持。TGM6基因突变与脊髓小脑性共济失调35型(SCA35)相关,该病为常染色体显性遗传的神经退行性疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 脊髓小脑性共济失调35型 | TGM6基因突变导致蛋白功能异常,影响小脑神经元功能,导致共济失调等症状。 | 已明确致病 |
| 其他神经退行性疾病 | 部分研究提示TGM6可能与其他神经退行性疾病相关,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 小脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 大脑皮层 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| SK-N-SH | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1550T>C (p.Leu517Pro) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能异常 |
| c.1327G>A (p.Asp443Asn) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1171C>T (p.Arg391Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
部分突变可能导致蛋白功能丧失,影响转谷氨酰胺酶活性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分突变可能具有显性负效应,干扰正常蛋白功能。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003810 (protein-glutamine gamma-glutamyltransferase activity) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0005634 (nucleus) |
相关通路
• hsa00350 (Tyrosine metabolism)
• hsa04151 (PI3K-Akt signaling pathway)
蛋白质功能简介
TGM6蛋白属于转谷氨酰胺酶家族,催化蛋白质交联反应,参与细胞外基质稳定、细胞凋亡等过程。该蛋白主要在小脑和中枢神经系统中表达,可能参与神经元发育和突触可塑性。TGM6突变导致蛋白功能异常,进而引起小脑神经元功能障碍,导致脊髓小脑性共济失调35型。