THAP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
THAP1基因编码一种DNA结合蛋白,参与转录调控和细胞增殖,其突变与肌张力障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | THAP1 |
|---|---|
| 基因全名 | THAP domain containing 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 8p11.21 |
| NCBI Gene ID | 55145 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55145 |
| Ensembl ID | ENSG00000136826 |
| UniProt ID | Q9NVV9 |
| OMIM ID | 609520 |
| HGNC ID | 20856 |
| 基因别名 | THAP1, THAP domain containing 1, DYT6, THAP domain-containing protein 1 |
基因功能与研究简介
THAP1基因编码THAP结构域蛋白1,该蛋白是一种DNA结合蛋白,通过其N端的THAP结构域识别特异的DNA序列,参与转录调控、细胞周期调控和凋亡等过程。THAP1在多种组织中表达,尤其在脑组织中高表达。THAP1基因突变与原发性肌张力障碍6型(DYT6)相关,该病是一种神经系统运动障碍,表现为不自主的肌肉收缩和姿势异常。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 原发性肌张力障碍6型(DYT6) | THAP1基因突变导致单倍剂量不足或显性负效应,影响转录调控功能,导致神经元功能障碍 | 已明确致病 |
| 肌张力障碍 | THAP1突变与多种肌张力障碍表型相关,包括局灶性、节段性和全身性肌张力障碍 | 具有较强研究证据 |
| 癌症 | THAP1在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生发展,但具体机制尚不明确 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.474G>A (p.Trp158Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.484G>A (p.Gly162Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Loss of Function或Dominant Negative |
| c.506A>G (p.Asn169Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Loss of Function或Dominant Negative |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
THAP1突变导致蛋白功能丧失,如无义突变产生截短蛋白,可能通过单倍剂量不足机制致病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明THAP1突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分错义突变可能产生具有显性负效应的蛋白,干扰正常THAP1功能。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 (DNA binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0006355 (regulation of transcription | • DNA-templated) |
| • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• 暂无明确Pathway ID
蛋白质功能简介
THAP1蛋白由213个氨基酸组成,包含N端的THAP结构域(约90个氨基酸)和C端的卷曲螺旋结构域。THAP结构域是锌指基序,能特异性结合DNA序列(如AGAAAT)。THAP1在细胞核中表达,作为转录因子调控下游基因表达,参与细胞周期、凋亡和神经发育等过程。THAP1突变导致其功能异常,与肌张力障碍的发病机制密切相关。
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