THSD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
THSD1编码一种参与血管生成和细胞黏附的Ⅰ型跨膜蛋白,其突变与遗传性血管畸形相关。
基因信息卡
| 基因符号 | THSD1 |
|---|---|
| 基因全名 | thrombospondin type 1 domain containing 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 13q14.3 |
| NCBI Gene ID | 55901 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55901 |
| Ensembl ID | ENSG00000151615 |
| UniProt ID | Q9NS62 |
| OMIM ID | 616821 |
| HGNC ID | 16954 |
| 基因别名 | TMTSP, FLJ21908 |
基因功能与研究简介
THSD1(thrombospondin type 1 domain containing 1)基因编码一种Ⅰ型跨膜蛋白,属于血栓反应蛋白1型结构域家族。该蛋白在血管内皮细胞中高表达,参与血管生成、细胞黏附和迁移等过程。研究表明,THSD1通过其胞外域与整合素相互作用,调节内皮细胞功能。THSD1基因突变与遗传性血管畸形(如脑海绵状血管畸形)相关,但其确切致病机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 脑海绵状血管畸形 | THSD1突变导致蛋白功能丧失,影响血管内皮细胞黏附,导致血管结构异常。 | 已明确致病 |
| 血管畸形(其他) | 部分THSD1变异与散发性血管畸形相关,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HUVEC(人脐静脉内皮细胞) | 暂无可靠数据 | 内皮细胞,THSD1表达丰富 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系,用于过表达研究 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1534C>T (p.Arg512Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能被无义介导的mRNA降解 |
| c.1180G>A (p.Gly394Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响待验证 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
THSD1功能缺失突变(如无义突变)导致蛋白功能丧失,破坏内皮细胞黏附,与血管畸形相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明THSD1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明THSD1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155(细胞黏附) | • GO:0001525(血管生成) |
| • GO:0005886(质膜) | • GO:0005515(蛋白结合) |
相关通路
• hsa04510(黏着斑)
• hsa04360(轴突导向)
蛋白质功能简介
THSD1蛋白是一种Ⅰ型跨膜蛋白,包含一个信号肽、一个胞外区(含血栓反应蛋白1型结构域)、一个跨膜区和一个胞内区。该蛋白在内皮细胞中表达,参与细胞黏附、迁移和血管生成。其胞外域可与整合素αvβ3结合,调节内皮细胞功能。THSD1突变可能导致蛋白功能丧失,影响血管完整性,与脑海绵状血管畸形相关。