THSD7B基因|基因功能、疾病关联、突变与表达图谱
THSD7B编码一种I型跨膜蛋白,可能参与血管生成和细胞迁移,其表达异常与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | THSD7B |
|---|---|
| 基因全名 | thrombospondin type 1 domain containing 7B |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q22.1 |
| NCBI Gene ID | 399947 ncbi.nlm.nih.gov/gene/399947 |
| Ensembl ID | ENSG00000144136 |
| UniProt ID | Q9C0I4 |
| OMIM ID | 612348 |
| HGNC ID | 22208 |
| 基因别名 | FLJ40094, MGC16169 |
基因功能与研究简介
THSD7B(thrombospondin type 1 domain containing 7B)编码一种I型跨膜蛋白,属于THSD7家族。该蛋白包含多个thrombospondin type 1(TSP1)结构域,可能参与细胞外基质相互作用、血管生成和细胞迁移。THSD7B在多种组织中表达,尤其在胎盘和肾脏中高表达。研究表明,THSD7B的表达异常与多种癌症(如肾细胞癌、肝细胞癌)相关,可能作为潜在的肿瘤标志物或治疗靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肾细胞癌 | THSD7B在肾细胞癌中表达上调,可能通过促进血管生成和细胞迁移参与肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | THSD7B在肝细胞癌中高表达,与不良预后相关,可能通过调控上皮-间质转化(EMT)促进侵袭。 | 较强研究证据 |
| 膜性肾病 | THSD7B可能作为自身抗原参与膜性肾病(MN)的发病,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 胎盘 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达低 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 表达较高 |
| 786-O | 暂无可靠数据 | 表达较高 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.2345C>T (p.Arg782Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能为Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明THSD7B存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明THSD7B存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0007155 (cell adhesion) |
| • GO:0001525 (angiogenesis) | • GO:0016021 (integral component of membrane) |
相关通路
• hsa04510 (Focal adhesion)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
THSD7B蛋白是一种I型跨膜蛋白,包含多个TSP1结构域,可能参与细胞外基质相互作用和信号转导。该蛋白在血管生成和细胞迁移中发挥作用,其表达异常与多种癌症相关。目前对其具体分子机制的研究仍在进行中。