THUMPD2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

THUMPD2是一种RNA修饰相关蛋白,参与tRNA和mRNA的甲基化修饰,与多种癌症和神经发育疾病相关。

基因信息卡

基因符号 THUMPD2
基因全名 THUMP domain containing 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 2p22.3
NCBI Gene ID 80745 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80745
Ensembl ID ENSG00000115594
UniProt ID Q9BWT6
OMIM ID 612625
HGNC ID 23805
基因别名 FLJ20489, MGC131944

基因功能与研究简介

THUMPD2(THUMP domain containing 2)基因编码一种含有THUMP结构域的蛋白质,该结构域与RNA结合和修饰相关。THUMPD2蛋白参与tRNA和mRNA的甲基化修饰,特别是2'-O-甲基化,影响RNA的稳定性和功能。研究表明THUMPD2在多种癌症中表达异常,可能通过调控RNA修饰影响肿瘤发生发展。此外,THUMPD2突变与神经发育障碍相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 THUMPD2在多种癌症中表达上调或下调,可能通过影响RNA修饰促进肿瘤增殖和转移。 较强研究证据
神经发育障碍 THUMPD2突变与智力障碍和自闭症谱系障碍相关,可能通过影响RNA修饰导致神经发育异常。 较强研究证据
暂无明确致病性 目前尚无明确证据表明THUMPD2直接导致特定遗传病。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
A549 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但致病性未明确
c.456C>T (p.Pro152Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但致病性未明确
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致THUMPD2蛋白活性降低或丧失,可能影响RNA修饰,与疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明THUMPD2存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:目前暂无明确证据表明THUMPD2存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 (RNA binding) • GO:0008168 (methyltransferase activity)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

暂无明确通路数据

蛋白质功能简介

THUMPD2蛋白含有THUMP结构域,属于RNA修饰酶家族。它可能作为甲基转移酶,催化RNA的2'-O-甲基化,影响RNA的加工和功能。THUMPD2在细胞核和细胞质中均有分布,参与多种RNA代谢过程。

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