THUMPD3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

THUMPD3是一种RNA修饰相关蛋白,参与tRNA和mRNA的甲基化修饰,与神经发育和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 THUMPD3
基因全名 THUMP domain containing 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 3p21.31
NCBI Gene ID 25917 ncbi.nlm.nih.gov/gene/25917
Ensembl ID ENSG00000134046
UniProt ID Q9BWH6
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID HGNC:24006
基因别名 THUMPD3, FLJ22624, MGC126851

基因功能与研究简介

THUMPD3基因编码含有THUMP结构域的蛋白质,该结构域与RNA结合和修饰相关。THUMPD3参与tRNA和mRNA的甲基化修饰,特别是2'-O-甲基化,可能影响RNA的稳定性和翻译效率。研究表明THUMPD3在神经发育和癌症中发挥作用,但其具体机制仍在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育异常 THUMPD3突变可能导致RNA修饰异常,影响神经发育,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
癌症 THUMPD3在多种癌症中表达异常,可能通过影响RNA修饰促进肿瘤发生发展。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HepG2 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但证据不足
c.456C>T (p.Arg152Ter) 无义突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义突变导致蛋白截短,可能影响RNA修饰功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 (RNA binding) • GO:0008168 (methyltransferase activity)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)

相关通路

暂无可靠数据

蛋白质功能简介

THUMPD3蛋白含有THUMP结构域,可能参与RNA结合和甲基化修饰。其具体底物和功能仍在研究中,可能与tRNA和mRNA的2'-O-甲基化有关。

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