TIPE3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TIPE3(TNFAIP8L3)是肿瘤坏死因子α诱导蛋白8家族成员,参与免疫调节和肿瘤发生,是潜在的癌症治疗靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | TIPE3 |
|---|---|
| 基因全名 | TNF alpha induced protein 8 like 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q21.2 |
| NCBI Gene ID | 339479 ncbi.nlm.nih.gov/gene/339479 |
| Ensembl ID | ENSG00000137801 |
| UniProt ID | Q6P4A7 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:28209 |
| 基因别名 | TNFAIP8L3, FLJ14490 |
基因功能与研究简介
TIPE3(TNFAIP8L3)是肿瘤坏死因子α诱导蛋白8(TNFAIP8)家族的成员,该家族包括TNFAIP8、TIPE1、TIPE2和TIPE3。TIPE3在多种组织中表达,尤其在免疫细胞和某些肿瘤细胞中高表达。研究表明,TIPE3参与调控细胞增殖、凋亡、迁移和免疫反应,与多种癌症的发生发展密切相关。TIPE3可能通过调节NF-κB信号通路和磷脂酰肌醇信号通路发挥作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | TIPE3在肝细胞癌中高表达,可能通过促进细胞增殖和迁移参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | TIPE3在结直肠癌中表达上调,与肿瘤分期和预后相关。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | TIPE3在非小细胞肺癌中高表达,可能促进肿瘤进展。 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | TIPE3在乳腺癌中表达异常,可能影响肿瘤侵袭。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
| c.456C>T (p.R152*) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变可能导致蛋白功能丧失,影响其调控作用。
Gain of Function(功能获得,GOF)
某些错义突变可能增强TIPE3的促癌功能,但具体机制尚需研究。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明TIPE3突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005829 (cytosol) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007165 (signal transduction) | • GO:0008283 (cell population proliferation) |
| • GO:0006915 (apoptotic process) |
相关通路
• NF-kappa B signaling pathway (hsa04064)
• Phosphatidylinositol signaling system (hsa04070)
蛋白质功能简介
TIPE3蛋白属于TNFAIP8家族,包含一个DUF3585结构域,可能参与脂质第二信使的调控。TIPE3在细胞质和质膜中表达,通过与Gαi2等蛋白相互作用调节细胞信号转导。研究表明,TIPE3能够促进肿瘤细胞增殖和迁移,抑制凋亡,其表达水平与多种癌症的预后相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|