TLE1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TLE1是转录共抑制因子,在发育和肿瘤中发挥关键作用,其突变与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TLE1 |
|---|---|
| 基因全名 | TLE1 (TLE family member 1, transcriptional corepressor) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9q21.32 |
| NCBI Gene ID | 7081 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7081 |
| Ensembl ID | ENSG00000104853 |
| UniProt ID | Q04724 |
| OMIM ID | 600229 |
| HGNC ID | 11839 |
| 基因别名 | ESG, GRG1, TLE1 |
基因功能与研究简介
TLE1(Transducin-Like Enhancer of Split 1)是Groucho/TLE家族成员,作为转录共抑制因子,通过招募组蛋白去乙酰化酶等复合物抑制基因转录。TLE1在发育过程中调控多种信号通路,如Wnt和Notch通路,并在细胞分化、凋亡和肿瘤发生中发挥重要作用。TLE1的异常表达与多种癌症相关,尤其在滑膜肉瘤中高表达,是诊断标志物之一。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 滑膜肉瘤 | TLE1高表达,作为诊断标志物,可能通过抑制凋亡和促进增殖参与肿瘤发生 | 已明确致病 |
| 急性髓系白血病 | TLE1突变或表达异常可能影响造血分化,但具体机制尚在研究中 | 具有较强研究证据 |
| 结直肠癌 | TLE1表达下调与肿瘤进展相关,可能通过Wnt通路失调促进癌症 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | TLE1表达异常与预后相关,可能参与上皮-间质转化 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.567delC (p.Leu189Trpfs*23) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.890C>T (p.Pro297Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或相互作用 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致TLE1蛋白功能丧失或降低,可能影响转录抑制活性,与肿瘤发生相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明TLE1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明TLE1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003714 (transcription corepressor activity) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0006355 (regulation of transcription | • DNA-templated) |
| • GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II) |
相关通路
• Wnt signaling pathway (WP428)
• Notch signaling pathway (WP268)
蛋白质功能简介
TLE1蛋白属于Groucho/TLE家族,包含N端谷氨酰胺丰富区域和C端WD40重复结构域。它作为转录共抑制因子,通过直接与转录因子结合并招募组蛋白去乙酰化酶等复合物,抑制靶基因转录。TLE1在发育和细胞分化中调控关键基因表达,其异常表达与多种肿瘤相关。