TMED3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TMED3是p53靶基因,参与调控细胞凋亡和肿瘤抑制,与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 TMED3
基因全名 transmembrane p24 trafficking protein 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 15q25.1
NCBI Gene ID 23423 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23423
Ensembl ID ENSG00000137801
UniProt ID Q9Y3Q3
OMIM ID 610550
HGNC ID 24567
基因别名 p24b; 2510048G10Rik

基因功能与研究简介

TMED3(transmembrane p24 trafficking protein 3)是p24家族成员,定位于内质网-高尔基体中间区室(ERGIC),参与蛋白质运输和分泌途径。TMED3是p53的直接靶基因,其表达受p53调控,参与调控细胞凋亡和细胞周期阻滞,发挥肿瘤抑制作用。研究表明TMED3在多种癌症中表达下调,与肿瘤发生发展密切相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 TMED3表达下调与结直肠癌进展相关,可能通过影响p53通路促进肿瘤发生。 较强研究证据
肝细胞癌 TMED3在肝细胞癌中表达降低,与预后不良相关,可能作为肿瘤抑制因子。 较强研究证据
乳腺癌 TMED3表达异常与乳腺癌发生相关,可能参与调控细胞凋亡。 潜在关联
肺癌 TMED3在肺癌中表达下调,可能参与肿瘤抑制。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,可能影响TMED3功能
c.456G>A (p.Trp152Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,可能影响TMED3功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):突变导致TMED3蛋白功能丧失或减弱,可能影响其肿瘤抑制功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明TMED3存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明TMED3存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006886 (intracellular protein transport) • GO:0005783 (endoplasmic reticulum)
• GO:0005794 (Golgi apparatus) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0006915 (apoptotic process)

相关通路

p53 signaling pathway (hsa04115)
Protein processing in endoplasmic reticulum (hsa04141)

蛋白质功能简介

TMED3蛋白是p24家族成员,定位于内质网-高尔基体中间区室(ERGIC),参与蛋白质运输和分泌途径。TMED3是p53的直接靶基因,其表达受p53调控,参与调控细胞凋亡和细胞周期阻滞,发挥肿瘤抑制作用。研究表明TMED3在多种癌症中表达下调,与肿瘤发生发展密切相关。

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