TMEFF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TMEFF1是一种在神经系统中高表达的跨膜蛋白,参与细胞增殖与分化调控,与多种癌症和神经系统疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TMEFF1 |
|---|---|
| 基因全名 | Transmembrane Protein With EGF Like And Two Follistatin Like Domains 1 |
| 基因类型 | 蛋白编码基因 |
| 染色体位置 | 9q31.3 |
| NCBI Gene ID | 8577 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8577 |
| Ensembl ID | ENSG00000107104 |
| UniProt ID | Q8IYR6 |
| OMIM ID | 606111 |
| HGNC ID | 11866 |
| 基因别名 | H7365, C9orf2, CT120.1 |
基因功能与研究简介
TMEFF1(Transmembrane Protein With EGF Like And Two Follistatin Like Domains 1)是一种跨膜蛋白,包含一个EGF样结构域和两个卵泡抑素样结构域。该基因在多种组织中表达,尤其在脑组织中高表达。TMEFF1参与细胞增殖、分化和凋亡的调控,可能通过调节TGF-β信号通路发挥作用。研究表明,TMEFF1在多种癌症中表达异常,与肿瘤的发生发展密切相关。此外,TMEFF1还可能与神经系统疾病有关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | TMEFF1在多种癌症中表达下调或启动子甲基化,可能作为肿瘤抑制基因,通过抑制细胞增殖和诱导凋亡发挥作用。 | 较强研究证据 |
| 神经系统疾病 | TMEFF1在脑组织中高表达,可能参与神经发育和突触可塑性,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 高表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
| c.456delA (p.Lys152fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变:导致TMEFF1蛋白表达减少或功能缺失,可能促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:目前暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:目前暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0005576 (extracellular region) | • GO:0007165 (signal transduction) |
相关通路
• TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
• Pathways in cancer (hsa05200)
蛋白质功能简介
TMEFF1蛋白是一种I型跨膜蛋白,包含信号肽、胞外区(含EGF样结构域和两个卵泡抑素样结构域)、跨膜区和胞内区。该蛋白可能通过其胞外结构域与配体相互作用,调节细胞信号传导。研究表明,TMEFF1可能通过抑制TGF-β信号通路来抑制细胞增殖,从而发挥肿瘤抑制作用。此外,TMEFF1在神经系统中可能参与神经元分化。
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