TMEFF2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TMEFF2是一种在正常前列腺和脑组织中高表达的跨膜蛋白,可能作为肿瘤抑制因子参与前列腺癌的发生发展。
基因信息卡
| 基因符号 | TMEFF2 |
|---|---|
| 基因全名 | Transmembrane Protein With EGF Like And Two Follistatin Like Domains 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q32.3 |
| NCBI Gene ID | 23671 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23671 |
| Ensembl ID | ENSG00000144339 |
| UniProt ID | Q9UIK5 |
| OMIM ID | 605734 |
| HGNC ID | 11866 |
| 基因别名 | HPP1, TR, TENB2, TPEF |
基因功能与研究简介
TMEFF2(Transmembrane Protein With EGF Like And Two Follistatin Like Domains 2)基因编码一种I型跨膜蛋白,包含一个EGF样结构域和两个卵泡抑素样结构域。该蛋白在正常前列腺和脑组织中高表达,可能参与细胞增殖、分化和凋亡的调控。研究表明TMEFF2在前列腺癌中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。此外,TMEFF2还可能与神经发育和炎症反应有关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 前列腺癌 | TMEFF2在前列腺癌中表达下调,可能通过抑制细胞增殖和诱导凋亡发挥肿瘤抑制作用。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | TMEFF2在结直肠癌中表达降低,可能参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
| 胃癌 | TMEFF2在胃癌中表达下调,可能作为抑癌基因。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| LNCaP | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系,表达较低 |
| PC-3 | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系,表达较低 |
| DU145 | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系,表达较低 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
TMEFF2的错义或无义突变可能导致蛋白功能丧失,从而削弱其肿瘤抑制作用。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明TMEFF2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明TMEFF2突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0005576 (extracellular region) | • GO:0007165 (signal transduction) |
| • GO:0042127 (regulation of cell population proliferation) |
相关通路
• 暂无明确通路数据
蛋白质功能简介
TMEFF2蛋白是一种跨膜蛋白,包含信号肽、胞外区、跨膜区和胞内区。胞外区含有EGF样结构域和两个卵泡抑素样结构域,可能参与蛋白-蛋白相互作用。该蛋白在前列腺和脑中高表达,可能通过调节细胞信号通路影响细胞增殖和凋亡。研究表明TMEFF2可能作为肿瘤抑制因子,在前列腺癌中表达下调。