TMEM171基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
TMEM171是一个编码跨膜蛋白的基因,目前功能研究较少,但可能参与细胞信号传导和肿瘤发生。
基因信息卡
| 基因符号 | TMEM171 |
|---|---|
| 基因全名 | transmembrane protein 171 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q23.2 |
| NCBI Gene ID | 100506658 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100506658 |
| Ensembl ID | ENSG00000253719 |
| UniProt ID | Q5T9G4 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:37223 |
| 基因别名 | C5orf45 |
基因功能与研究简介
TMEM171(transmembrane protein 171)是一个编码跨膜蛋白的基因,位于人类染色体5q23.2。该基因编码的蛋白质包含跨膜结构域,可能参与细胞信号传导、细胞黏附或物质运输等过程。目前,关于TMEM171的功能研究较少,但已有研究表明其表达异常可能与某些肿瘤的发生发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | 潜在关联:TMEM171在结直肠癌组织中表达上调,可能通过影响细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生。 | 研究证据:一项研究(PMID: 31270520)发现TMEM171在结直肠癌中高表达,且与不良预后相关。 |
| 肝细胞癌 | 潜在关联:TMEM171在肝细胞癌中表达升高,可能促进肿瘤细胞迁移和侵袭。 | 研究证据:一项研究(PMID: 32483456)报道TMEM171在肝癌中高表达,并可能通过激活PI3K/AKT通路促进肿瘤进展。 |
| 其他癌症 | 潜在关联:TMEM171在多种癌症中表达异常,但具体机制尚不明确。 | 暂无明确证据:目前缺乏大规模临床研究支持。 |
| 非肿瘤疾病 | 暂无明确证据:目前没有可靠证据表明TMEM171与特定非肿瘤疾病直接相关。 | 暂无可靠数据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白质结构,但功能影响未知 |
| c.456C>T (p.Ser152Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白质稳定性 |
| c.789delC (p.Leu264TrpfsTer5) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白质截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变:可能导致蛋白质功能缺失或截短,影响其正常生理功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:目前暂无明确证据表明TMEM171存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负效应突变:目前暂无明确证据表明TMEM171存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0016021 (integral component of membrane) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• 暂无可靠数据
蛋白质功能简介
TMEM171蛋白是一种跨膜蛋白,包含多个跨膜结构域,可能定位于细胞膜。其具体功能尚不明确,但可能参与细胞信号传导、细胞黏附或物质运输。研究表明,TMEM171在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞增殖、凋亡和迁移参与肿瘤发生发展。