TMPRSS13基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TMPRSS13是一种II型跨膜丝氨酸蛋白酶,参与蛋白水解级联反应,与病毒感染和癌症进展相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TMPRSS13 |
|---|---|
| 基因全名 | transmembrane serine protease 13 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q23.3 |
| NCBI Gene ID | 84000 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84000 |
| Ensembl ID | ENSG00000137710 |
| UniProt ID | Q9BYE2 |
| OMIM ID | 610300 |
| HGNC ID | 29850 |
| 基因别名 | MSPL, TMPRSS13, transmembrane protease serine 13 |
基因功能与研究简介
TMPRSS13(transmembrane serine protease 13)属于II型跨膜丝氨酸蛋白酶家族,具有一个胞外丝氨酸蛋白酶结构域。该蛋白在多种组织中表达,参与蛋白水解级联反应,可能涉及细胞外基质降解、病毒感染(如流感病毒和冠状病毒)的激活以及肿瘤进展。研究表明,TMPRSS13可切割多种底物,包括激肽原和病毒刺突蛋白。其表达异常与多种癌症相关,但具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症(多种类型) | TMPRSS13在多种癌症中表达上调,可能通过促进细胞外基质降解和激活生长因子来促进肿瘤侵袭和转移。 | 较强研究证据 |
| 病毒感染(流感病毒、冠状病毒) | TMPRSS13可切割病毒刺突蛋白,促进病毒进入宿主细胞,可能参与病毒感染过程。 | 较强研究证据 |
| 暂无明确致病性突变相关疾病 | 目前尚无明确证据表明TMPRSS13突变直接导致遗传性疾病。 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| A549(肺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| MCF7(乳腺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa(宫颈癌细胞系) | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs61735792 | SNV | 暂无可靠数据 | 同义突变,功能影响未知 |
| rs61735793 | SNV | 暂无可靠数据 | 错义突变,功能影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致TMPRSS13蛋白表达减少或活性丧失,可能影响其正常生理功能,但具体疾病关联尚不明确。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:可能增强TMPRSS13的蛋白酶活性或底物特异性,与癌症进展或病毒感染易感性相关,但证据有限。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白可能干扰野生型蛋白的功能,但目前在TMPRSS13中尚无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0006508 (proteolysis) | • GO:0016021 (integral component of membrane) |
相关通路
• KEGG: hsa05164 (Influenza A)
• KEGG: hsa05171 (Coronavirus disease - COVID-19)
蛋白质功能简介
TMPRSS13蛋白是一种II型跨膜丝氨酸蛋白酶,由胞内N端、跨膜区和胞外C端丝氨酸蛋白酶结构域组成。它可能通过切割细胞外基质成分和激活生长因子参与组织重塑和肿瘤进展。此外,TMPRSS13能切割多种病毒刺突蛋白,促进病毒进入宿主细胞,因此可能作为抗病毒药物靶点。其表达调控和底物特异性仍需进一步研究。