TMTC2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
TMTC2编码内质网跨膜蛋白,参与O-甘露糖基化,与常染色体隐性遗传性耳聋DFNB107相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TMTC2 |
|---|---|
| 基因全名 | Transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12q21.31 |
| NCBI Gene ID | 160335 ncbi.nlm.nih.gov/gene/160335 |
| Ensembl ID | ENSG00000179094 |
| UniProt ID | Q8N2W1 |
| OMIM ID | 615856 |
| HGNC ID | 25409 |
| 基因别名 | DKFZp686O24117, FLJ14700, MGC138499 |
基因功能与研究简介
TMTC2基因编码内质网跨膜蛋白,属于TMTC家族,参与钙黏蛋白的O-甘露糖基化过程,对蛋白折叠和运输至关重要。该基因突变与常染色体隐性遗传性耳聋DFNB107相关,可能影响内耳毛细胞的正常功能。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 常染色体隐性遗传性耳聋DFNB107 | TMTC2基因突变导致蛋白功能丧失,影响内耳毛细胞中钙黏蛋白的O-甘露糖基化,进而损害毛细胞功能,导致听力下降。 | 已明确致病(OMIM) |
| 癌症相关 | 暂无明确证据表明TMTC2直接参与癌症发生,但部分研究提示其表达异常可能与肿瘤进展相关,需进一步验证。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1996C>T (p.Arg666Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.2387G>A (p.Trp796Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型):突变导致蛋白功能缺失,如无义突变引起的截短蛋白,与耳聋相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型):目前暂无明确证据表明TMTC2存在此类突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负效型):目前暂无明确证据表明TMTC2存在此类突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006486 (protein glycosylation) | • GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane) |
| • GO:0005509 (calcium ion binding) |
相关通路
• O-mannosyl glycosylation pathway (Reactome: R-HSA-5694530)
蛋白质功能简介
TMTC2蛋白是一种内质网跨膜蛋白,含有多个四肽重复(TPR)结构域,可能参与蛋白-蛋白相互作用。其功能主要涉及钙黏蛋白的O-甘露糖基化,该修饰对蛋白的正确折叠和运输至关重要。TMTC2突变导致蛋白功能丧失,进而影响内耳毛细胞中钙黏蛋白的修饰,最终导致听力损失。