TNIK基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TNIK是一种参与Wnt信号通路和细胞骨架调控的丝氨酸/苏氨酸激酶,在多种癌症中异常表达,是潜在的药物靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | TNIK |
|---|---|
| 基因全名 | TRAF2 and NCK interacting kinase |
| 基因类型 | protein-coding gene |
| 染色体位置 | 3q26.2 |
| NCBI Gene ID | 23043 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23043 |
| Ensembl ID | ENSG00000145332 |
| UniProt ID | Q9UKE5 |
| OMIM ID | 610005 |
| HGNC ID | 30765 |
| 基因别名 | KIAA0551 |
基因功能与研究简介
TNIK(TRAF2 and NCK interacting kinase)是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,属于STE20家族。它参与多种细胞过程,包括Wnt信号通路、细胞骨架重组、细胞迁移和增殖。TNIK通过与TRAF2和NCK相互作用,调节JNK和NF-κB信号通路。在多种癌症中,TNIK表达异常,与肿瘤发生和发展密切相关。此外,TNIK还参与神经元突触形成和记忆功能。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | TNIK在结直肠癌中高表达,通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤细胞增殖和迁移。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | TNIK在肝细胞癌中表达上调,与肿瘤侵袭和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | TNIK在胃癌中表达升高,可能通过调控细胞周期和凋亡参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | TNIK在非小细胞肺癌中表达增加,与肿瘤进展相关。 | 潜在关联 |
| 精神分裂症 | TNIK基因变异与精神分裂症风险相关,可能影响突触功能。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响激酶活性 |
| c.2345C>T (p.Arg782Trp) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白结构 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致TNIK激酶活性降低或蛋白失活,可能影响Wnt信号通路和细胞增殖。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:增强TNIK激酶活性,可能促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白干扰野生型TNIK功能,可能影响信号通路。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity) | • GO:0005524 (ATP binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005813 (centrosome) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0016020 (membrane) |
| • GO:0035556 (intracellular signal transduction) | • GO:0048013 (hepatocyte growth factor receptor signaling pathway) |
| • GO:0060070 (canonical Wnt signaling pathway) | • GO:0007010 (cytoskeleton organization) |
相关通路
• Wnt signaling pathway (KEGG: hsa04310)
• Regulation of actin cytoskeleton (KEGG: hsa04810)
• MAPK signaling pathway (KEGG: hsa04010)
蛋白质功能简介
TNIK蛋白由1360个氨基酸组成,包含N端激酶结构域、中间区域和C端卷曲螺旋结构域。它作为MAP4K家族成员,通过磷酸化下游底物(如β-catenin)调节Wnt信号通路。TNIK还通过与NCK和TRAF2相互作用参与JNK和NF-κB信号传导。在细胞中,TNIK定位于细胞质、细胞膜和中心体,参与细胞迁移和分裂。