TNPO3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TNPO3编码转运蛋白3,参与核质运输和RNA加工,与肌营养不良和病毒感染相关。

基因信息卡

基因符号 TNPO3
基因全名 Transportin 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q32.1
NCBI Gene ID 23534 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23534
Ensembl ID ENSG00000064419
UniProt ID Q9Y5L0
OMIM ID 610032
HGNC ID 11971
基因别名 TRN-SR, IPO12, MTR10A, transportin-SR

基因功能与研究简介

TNPO3基因编码转运蛋白3(Transportin 3),属于importin-β家族,主要介导丝氨酸/精氨酸丰富(SR)蛋白的核质运输,参与RNA剪接和加工。TNPO3在细胞核质运输中发挥关键作用,并参与HIV-1病毒基因组的核输入。TNPO3突变可导致肢带型肌营养不良1F型(LGMD1F),并可能影响病毒感染的易感性。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肢带型肌营养不良1F型 TNPO3基因突变导致蛋白功能异常,影响肌肉细胞核质运输,导致肌营养不良。 已明确致病
HIV感染 TNPO3参与HIV-1病毒基因组的核输入,其表达水平影响病毒感染效率。 具有较强研究证据
癌症 TNPO3在多种癌症中表达异常,可能影响肿瘤发生发展,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肌肉 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
C2C12 暂无可靠数据 小鼠成肌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2771G>A (p.Arg924Gln) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与LGMD1F相关
c.2770C>T (p.Arg924Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与LGMD1F相关
c.2771G>T (p.Arg924Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与LGMD1F相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

TNPO3突变可能导致蛋白功能丧失,影响核质运输,导致肌营养不良。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005488 (binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0006606 (protein import into nucleus) • GO:0006886 (intracellular protein transport)
• GO:0008139 (nuclear localization sequence binding) • GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore)
• GO:0031267 (small GTPase binding) • GO:0042802 (identical protein binding)
• GO:0044877 (protein-containing complex binding) • GO:0051020 (GTPase binding)

相关通路

Pathway: Nuclear import of HIV-1 (Reactome: R-HSA-180746)
Pathway: HIV Life Cycle (Reactome: R-HSA-162587)
Pathway: Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript (Reactome: R-HSA-72203)

蛋白质功能简介

TNPO3蛋白属于importin-β家族,包含多个HEAT重复结构域,主要识别底物蛋白的富含丝氨酸/精氨酸(SR)结构域,介导其核质运输。TNPO3在RNA剪接、mRNA输出和病毒核输入中发挥重要作用。其功能异常与肌营养不良和病毒感染相关。

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