TNRC6A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TNRC6A是miRNA介导的基因沉默通路中的关键支架蛋白,参与转录后调控,与多种疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TNRC6A |
|---|---|
| 基因全名 | trinucleotide repeat containing adaptor 6A |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16p11.2 |
| NCBI Gene ID | 27327 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27327 |
| Ensembl ID | ENSG00000121988 |
| UniProt ID | Q8NDV7 |
| OMIM ID | 610739 |
| HGNC ID | 11967 |
| 基因别名 | CAGH4; GW182; TNRC6 |
基因功能与研究简介
TNRC6A(trinucleotide repeat containing adaptor 6A)编码一种支架蛋白,是miRNA介导的基因沉默复合体(miRISC)的核心组分。该蛋白通过结合AGO蛋白和PABPC1,参与mRNA的翻译抑制和降解,调控基因表达。TNRC6A在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。其功能异常与神经发育障碍和癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 精神发育迟滞 | TNRC6A突变可能导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 | ClinVar有致病性变异报道,但证据有限。 |
| 结直肠癌 | TNRC6A表达异常可能影响miRNA调控网络,促进肿瘤发生。 | 研究证据:多项研究表明TNRC6A在结直肠癌中表达下调或突变。 |
| 乳腺癌 | TNRC6A可能通过调控miRNA影响乳腺癌进展。 | 研究证据:有研究显示TNRC6A在乳腺癌中表达异常。 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据GTEx) |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据GTEx) |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达(根据GTEx) |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达(根据GTEx) |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但致病性未明确。 |
| c.4567C>T (p.Arg1523Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能引起功能丧失。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变或移码突变导致蛋白功能丧失,可能影响miRNA调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0003729 mRNA binding |
| • GO:0035195 gene silencing by miRNA | • GO:0005737 cytoplasm |
相关通路
• hsa05200 Pathways in cancer
• hsa03018 RNA degradation
蛋白质功能简介
TNRC6A蛋白是miRNA诱导沉默复合体(miRISC)的关键组分,包含多个功能域:N端GW重复序列介导与AGO蛋白相互作用,C端包含RNA结合域和PABPC1结合位点。该蛋白参与mRNA的翻译抑制和脱腺苷化,调控基因表达。其表达异常与多种疾病相关。