TOB1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TOB1(Transducer of ERBB2, 1)是一种抗增殖蛋白,参与细胞周期调控和肿瘤抑制,在多种癌症中表达下调。
基因信息卡
| 基因符号 | TOB1 |
|---|---|
| 基因全名 | Transducer of ERBB2, 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q21.33 |
| NCBI Gene ID | 10140 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10140 |
| Ensembl ID | ENSG00000141298 |
| UniProt ID | P50616 |
| OMIM ID | 605523 |
| HGNC ID | 11979 |
| 基因别名 | TOB, APRO5, TROB1 |
基因功能与研究简介
TOB1(Transducer of ERBB2, 1)基因编码一种抗增殖蛋白,属于TOB/BTG家族。该蛋白参与细胞周期调控、转录调控和信号转导,通过抑制细胞增殖发挥肿瘤抑制作用。TOB1在多种正常组织中表达,但在多种癌症中表达下调或缺失,提示其可能作为肿瘤抑制因子。研究表明,TOB1通过调控细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂(如p21)的表达,以及影响TGF-β信号通路,参与细胞生长抑制。此外,TOB1还参与mRNA的降解和翻译调控。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肺癌 | TOB1表达下调与肺癌的发生发展相关,可能通过解除细胞周期抑制促进肿瘤增殖。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | TOB1在乳腺癌中表达降低,与不良预后相关,可能通过调控ERBB2信号通路影响肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肝癌 | TOB1在肝细胞癌中表达下调,与肿瘤侵袭和转移相关。 | 研究证据 |
| 结直肠癌 | TOB1表达减少与结直肠癌的进展和预后不良相关。 | 研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.100C>T (p.Arg34Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,可能丧失抗增殖功能 |
| c.200delA (p.Asn67IlefsTer5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,可能丧失抗增殖功能 |
| c.350A>G (p.Asp117Gly) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但具体影响需进一步研究 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失型突变):导致TOB1蛋白功能丧失或减弱,可能解除细胞周期抑制,促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明TOB1存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明TOB1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0008284 positive regulation of cell population proliferation |
| • GO:0008285 negative regulation of cell population proliferation | • GO:0007049 cell cycle |
| • GO:0000122 negative regulation of transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
• Cell cycle (hsa04110)
• ErbB signaling pathway (hsa04012)
蛋白质功能简介
TOB1蛋白由345个氨基酸组成,包含一个N端APRO域和一个C端TOB域。该蛋白主要定位于细胞核和细胞质,通过与多种蛋白相互作用参与细胞周期调控和转录抑制。TOB1能够抑制细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的活性,从而阻止细胞从G1期进入S期。此外,TOB1还参与mRNA的降解过程,通过结合CCR4-NOT复合物调控特定mRNA的稳定性。