TOX3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TOX3基因编码一种参与钙信号转导和转录调控的核蛋白,与乳腺癌、神经发育及多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 TOX3
基因全名 TOX high mobility group box family member 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 16q12.1
NCBI Gene ID 27324 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27324
Ensembl ID ENSG00000103495
UniProt ID O15405
OMIM ID 611416
HGNC ID 11979
基因别名 CAGF9, TNRC9, TRX3

基因功能与研究简介

TOX3基因编码一种含有高迁移率族(HMG)盒结构域的核蛋白,属于TOX家族。该蛋白在多种组织中表达,尤其在乳腺、脑和免疫细胞中丰富。TOX3参与钙信号转导和转录调控,可能通过结合DNA和调节基因表达来影响细胞增殖、分化和凋亡。研究表明,TOX3基因的变异与乳腺癌、神经发育障碍和自身免疫疾病等存在关联。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 TOX3基因的SNP(如rs3803662)与乳腺癌风险相关,可能通过影响基因表达和雌激素信号通路发挥作用。 较强研究证据
神经发育障碍 TOX3在脑组织中高表达,可能参与神经元分化,但具体机制尚不明确。 潜在关联
自身免疫疾病 TOX3可能参与T细胞功能调节,与类风湿关节炎等自身免疫疾病相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
乳腺 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 高表达
免疫组织 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF-7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs3803662 SNP 常见(约25%) 位于TOX3基因附近,可能影响基因表达,与乳腺癌风险相关
rs4784227 SNP 常见(约20%) 与乳腺癌风险相关,可能影响TOX3表达
rs12443621 SNP 常见(约30%) 与乳腺癌风险相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明TOX3的LoF突变导致疾病,但可能影响其转录调控功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明TOX3的GoF突变导致疾病。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明TOX3的显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II)

相关通路

hsa04020 (Calcium signaling pathway)
hsa04915 (Estrogen signaling pathway)

蛋白质功能简介

TOX3蛋白包含一个HMG盒结构域,能够结合DNA并参与转录调控。它可能通过与钙调蛋白相互作用,响应细胞内钙信号,调节靶基因表达。在乳腺癌中,TOX3可能通过影响雌激素受体信号通路来促进肿瘤发生。此外,TOX3在神经系统中可能参与神经元分化,但具体机制尚需进一步研究。

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