TPM3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TPM3编码原肌球蛋白3,参与肌动蛋白丝稳定,其突变与线状体肌病和某些癌症相关。

基因信息卡

基因符号 TPM3
基因全名 tropomyosin 3
基因类型 protein coding
染色体位置 1q21.3
NCBI Gene ID 7170 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7170
Ensembl ID ENSG00000143549
UniProt ID P06753
OMIM ID 191030
HGNC ID 12012
基因别名 NEM1, TM-30, TM30, TM3, TPM3u, tropomyosin 3

基因功能与研究简介

TPM3基因编码原肌球蛋白3(tropomyosin 3),属于原肌球蛋白家族,主要表达于骨骼肌和心肌,也存在于其他组织。原肌球蛋白与肌动蛋白丝结合,稳定微丝结构,并参与肌肉收缩的调控。TPM3基因突变可导致线状体肌病(nemaline myopathy),此外,TPM3的异常表达与某些癌症(如甲状腺癌、乳腺癌)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
线状体肌病 TPM3基因突变导致原肌球蛋白功能异常,影响肌动蛋白丝稳定性,导致肌纤维结构异常,表现为肌无力、肌张力低下等。 已明确致病
甲状腺癌 TPM3基因与NTRK1基因融合(TPM3-NTRK1)可导致甲状腺乳头状癌,属于基因融合导致的致癌驱动事件。 癌症相关
乳腺癌 TPM3表达异常与乳腺癌的侵袭和转移相关,但具体机制尚在研究中。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
心肌 暂无可靠数据 高表达
甲状腺 暂无可靠数据 中等表达
乳腺 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
C2C12(小鼠成肌细胞) 暂无可靠数据 分化过程中表达增加
MCF7(人乳腺癌细胞) 暂无可靠数据 表达水平与侵袭性相关
TPC-1(人甲状腺乳头状癌细胞) 暂无可靠数据 存在TPM3-NTRK1融合
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.502C>T (p.Arg168Cys) 错义突变 罕见 可能影响原肌球蛋白与肌动蛋白的结合,导致功能异常
c.574G>A (p.Glu192Lys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性,与线状体肌病相关
TPM3-NTRK1融合 基因融合 在甲状腺癌中常见 导致组成性激活的NTRK1激酶,促进肿瘤发生
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

TPM3的错义突变可能导致原肌球蛋白功能丧失或降低,影响肌动蛋白丝稳定性,导致肌肉功能障碍。

Gain of Function(功能获得,GOF)

TPM3-NTRK1融合基因产生具有组成性激酶活性的融合蛋白,属于功能获得性突变,促进细胞增殖和肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

某些TPM3突变可能产生异常蛋白,干扰正常原肌球蛋白的功能,具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003779 (actin binding) • GO:0006936 (muscle contraction)
• GO:0005862 (muscle thin filament) • GO:0005515 (protein binding)

相关通路

Reactome: Muscle contraction (R-HSA-397014)
KEGG: Cardiac muscle contraction (hsa04260)
KEGG: Adrenergic signaling in cardiomyocytes (hsa04261)

蛋白质功能简介

TPM3编码的原肌球蛋白3是肌动蛋白结合蛋白,在肌肉细胞中与肌动蛋白丝结合,稳定微丝结构并调节肌肉收缩。在非肌肉细胞中,TPM3可能参与细胞骨架动态调控。TPM3的突变可导致线状体肌病,而TPM3-NTRK1融合蛋白在甲状腺癌中具有致癌作用。

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