TPRKB基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TPRKB是KEOPS复合物的核心亚基，参与tRNA修饰和端粒维持，其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TPRKB |
|---|---|
| 基因全名 | TPRKB, TP53RK binding protein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2p13.3 |
| NCBI Gene ID | 51002 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51002 |
| Ensembl ID | ENSG00000115956 |
| UniProt ID | Q9Y3C4 |
| OMIM ID | 609224 |
| HGNC ID | 24259 |
| 基因别名 | CGI-121, CGI121, TP53RK binding protein |
基因功能与研究简介
TPRKB（TP53RK binding protein）是KEOPS复合物的一个亚基，该复合物在真核生物中参与tRNA的N6-苏氨酰氨基甲酰腺苷（t6A）修饰，以及端粒维持和转录调控。TPRKB通过与TP53RK（也称为PRPK）相互作用，可能参与p53信号通路。研究表明，TPRKB的突变与神经发育障碍相关，包括智力障碍和发育迟缓。此外，TPRKB在多种癌症中表达异常，可能作为潜在的治疗靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | TPRKB基因突变导致KEOPS复合物功能受损，影响tRNA修饰和端粒维持，进而导致神经发育异常。 | ClinVar, OMIM |
| 智力障碍 | TPRKB纯合或复合杂合突变与常染色体隐性遗传的智力障碍相关。 | ClinVar, OMIM |
| 发育迟缓 | TPRKB突变患者表现为发育迟缓、肌张力低下等。 | ClinVar |
| 癌症 | TPRKB在多种肿瘤中表达上调，可能通过影响p53通路促进肿瘤发生，但具体机制尚不明确。 | COSMIC, PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.238C>T (p.Arg80Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.497G>A (p.Trp166Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 起始密码子突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.IVS2+1G>A | 剪接突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
TPRKB功能缺失突变导致KEOPS复合物活性降低，影响tRNA修饰和端粒维持，是神经发育障碍的主要致病机制。
Gain of Function（功能获得，GOF）
暂无明确证据表明TPRKB存在功能获得性突变。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
暂无明确证据表明TPRKB突变具有显性负效应。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0006400 tRNA modification |
| • GO:0000723 telomere maintenance |
相关通路
• KEOPS complex pathway
• tRNA modification pathway
• Telomere maintenance pathway
蛋白质功能简介
TPRKB蛋白是KEOPS复合物的一个亚基，该复合物在真核生物中催化tRNA的t6A修饰，并参与端粒维持。TPRKB与TP53RK相互作用，可能参与p53信号通路。TPRKB蛋白包含一个保守的P-loop NTPase结构域，可能具有ATP结合活性。TPRKB在细胞核和细胞质中均有定位，其功能缺失与神经发育障碍相关。
联系电话