TRABD2B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TRABD2B是一种金属蛋白酶,参与Wnt信号通路调控,与遗传性视网膜疾病相关。

基因信息卡

基因符号 TRABD2B
基因全名 TRA domain containing 2B
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p36.22
NCBI Gene ID 84695 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84695
Ensembl ID ENSG00000142609
UniProt ID Q5T1M5
OMIM ID 615862
HGNC ID 26121
基因别名 MGC29643

基因功能与研究简介

TRABD2B(TRA domain containing 2B)基因编码一种金属蛋白酶,属于TRA(thrombospondin type 1 repeat)结构域蛋白家族。该蛋白在Wnt信号通路中发挥作用,通过切割Wnt配体来调节其活性。TRABD2B在多种组织中表达,尤其在视网膜中高表达。研究表明,TRABD2B突变与常染色体隐性遗传性视网膜疾病相关,如视网膜色素变性。此外,TRABD2B可能参与其他生物学过程,如细胞增殖和分化。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
视网膜色素变性 已明确致病 OMIM
Leber先天性黑矇 具有较强研究证据 OMIM
癌症 潜在关联 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
视网膜 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
ARPE-19 暂无可靠数据 视网膜色素上皮细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.152T>C (p.Leu51Pro) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.457C>T (p.Arg153Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
c.1000delA (p.Thr334ProfsTer23) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变、移码突变等导致蛋白功能丧失,与视网膜疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004222 (metalloendopeptidase activity) • GO:0006508 (proteolysis)
• GO:0016055 (Wnt signaling pathway) • GO:0005886 (plasma membrane)

相关通路

Wnt signaling pathway (Reactome: R-HSA-195721)

蛋白质功能简介

TRABD2B蛋白是一种金属蛋白酶,属于TRA结构域家族。它通过切割Wnt配体来调节Wnt信号通路,从而影响细胞增殖、分化和凋亡。在视网膜中,TRABD2B对于光感受器细胞的正常功能至关重要。突变导致蛋白功能丧失,进而引发视网膜色素变性等疾病。

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