TRAIP基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TRAIP(TRAF相互作用蛋白)是DNA损伤应答和细胞周期调控的关键因子,其突变与多种发育障碍和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 TRAIP
基因全名 TRAF interacting protein
基因类型 protein-coding
染色体位置 3p21.31
NCBI Gene ID 10206 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10206
Ensembl ID ENSG00000114021
UniProt ID Q9BWF2
OMIM ID 609937
HGNC ID 30764
基因别名 RNF206, TRIP

基因功能与研究简介

TRAIP(TRAF相互作用蛋白)是一种E3泛素连接酶,参与DNA损伤应答、细胞周期调控和染色体稳定性维持。它通过与TRAF家族蛋白相互作用,调节NF-κB信号通路,并在DNA复制应激时发挥关键作用。TRAIP功能异常与多种疾病相关,包括发育障碍和癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Seckel综合征 已明确致病 TRAIP基因纯合突变导致Seckel综合征,表现为小头畸形、生长迟缓等。证据来自OMIM和ClinVar。
小头畸形 已明确致病 TRAIP突变导致原发性小头畸形,与DNA损伤应答缺陷相关。证据来自OMIM和ClinVar。
乳腺癌 具有较强研究证据 TRAIP表达异常与乳腺癌发生发展相关,可能通过影响DNA修复和细胞周期。证据来自COSMIC和文献。
肺癌 具有较强研究证据 TRAIP在肺癌中表达上调,可能促进肿瘤进展。证据来自COSMIC和文献。
结直肠癌 潜在关联 TRAIP突变或表达改变与结直肠癌风险相关,但机制尚不明确。证据来自COSMIC和文献。

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
MCF7 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失。
c.567_568del (p.Glu190fs) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致蛋白截短,功能丧失。
c.890A>G (p.Tyr297Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,功能未知。
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失型):导致TRAIP蛋白功能缺失或减弱,常见于无义突变、移码突变等,与Seckel综合征等疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型):目前暂无明确证据表明TRAIP存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明TRAIP存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 • GO:0004842
• GO:0006281 • GO:0006974
• GO:0007049

相关通路

hsa03440
hsa04110
hsa04064

蛋白质功能简介

TRAIP蛋白由535个氨基酸组成,包含RING finger结构域和 coiled-coil 区域。作为E3泛素连接酶,TRAIP参与泛素化修饰底物蛋白,调控DNA损伤修复、细胞周期检查点及染色体稳定性。在DNA复制应激时,TRAIP被招募至停滞的复制叉,促进复制叉重启和修复。此外,TRAIP还参与NF-κB信号通路的调控,影响免疫应答。

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