TRAPPC11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TRAPPC11是转运蛋白颗粒复合物(TRAPP)的关键亚基,参与细胞内囊泡运输和自噬,其突变可导致肌营养不良和神经发育障碍。
基因信息卡
| 基因符号 | TRAPPC11 |
|---|---|
| 基因全名 | trafficking protein particle complex subunit 11 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 4q35.1 |
| NCBI Gene ID | 60684 ncbi.nlm.nih.gov/gene/60684 |
| Ensembl ID | ENSG00000138668 |
| UniProt ID | Q9H0A9 |
| OMIM ID | 614138 |
| HGNC ID | 25751 |
| 基因别名 | GTL11, TRS31, PPP1R135 |
基因功能与研究简介
TRAPPC11基因编码转运蛋白颗粒复合物(TRAPP)的亚基,该复合物在细胞内囊泡运输中发挥关键作用,特别是内质网到高尔基体的运输。TRAPPC11还参与自噬过程。该基因的突变可导致多种疾病,包括肢带型肌营养不良症2S型(LGMD2S)和神经发育障碍。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肢带型肌营养不良症2S型(LGMD2S) | TRAPPC11突变导致蛋白功能丧失,影响囊泡运输和自噬,导致肌肉细胞功能障碍和退化。 | 已明确致病 |
| 神经发育障碍伴运动异常和肌张力障碍 | TRAPPC11突变影响神经元发育和功能,导致运动障碍和肌张力异常。 | 已明确致病 |
| 肌阵挛性癫痫伴破碎红纤维(MERRF)样综合征 | 部分TRAPPC11突变与线粒体功能障碍相关,可能参与MERRF样表型。 | 具有较强研究证据 |
| 肝病 | TRAPPC11突变可能影响肝细胞自噬和囊泡运输,导致肝损伤。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肌肉 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| C2C12 | 暂无可靠数据 | 肌细胞分化中表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1287+5G>T | 剪接位点突变 | 罕见 | 导致外显子跳跃,蛋白截短,功能丧失 |
| p.Gly835Arg | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白折叠或稳定性,功能部分丧失 |
| p.Arg120Trp | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白相互作用,功能改变 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数致病突变导致蛋白功能丧失,如剪接位点突变导致截短蛋白。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006888 (ER to Golgi vesicle-mediated transport) | • GO:0006914 (autophagy) |
| • GO:0005794 (Golgi apparatus) | • GO:0005829 (cytosol) |
| • GO:0030126 (TRAPP complex) |
相关通路
• hsa04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum)
• hsa04144 (Endocytosis)
• hsa04140 (Autophagy - animal)
蛋白质功能简介
TRAPPC11蛋白是TRAPP复合物的核心亚基,参与囊泡运输和自噬。该蛋白包含一个N端的TRAPP结构域和一个C端的DUF729结构域,可能参与蛋白-蛋白相互作用。TRAPPC11在多种组织中表达,尤其在肌肉和脑中高表达。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
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