TRAPPC11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TRAPPC11是转运蛋白颗粒复合物(TRAPP)的关键亚基,参与细胞内囊泡运输和自噬,其突变可导致肌营养不良和神经发育障碍。

基因信息卡

基因符号 TRAPPC11
基因全名 trafficking protein particle complex subunit 11
基因类型 protein-coding
染色体位置 4q35.1
NCBI Gene ID 60684 ncbi.nlm.nih.gov/gene/60684
Ensembl ID ENSG00000138668
UniProt ID Q9H0A9
OMIM ID 614138
HGNC ID 25751
基因别名 GTL11, TRS31, PPP1R135

基因功能与研究简介

TRAPPC11基因编码转运蛋白颗粒复合物(TRAPP)的亚基,该复合物在细胞内囊泡运输中发挥关键作用,特别是内质网到高尔基体的运输。TRAPPC11还参与自噬过程。该基因的突变可导致多种疾病,包括肢带型肌营养不良症2S型(LGMD2S)和神经发育障碍。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肢带型肌营养不良症2S型(LGMD2S) TRAPPC11突变导致蛋白功能丧失,影响囊泡运输和自噬,导致肌肉细胞功能障碍和退化。 已明确致病
神经发育障碍伴运动异常和肌张力障碍 TRAPPC11突变影响神经元发育和功能,导致运动障碍和肌张力异常。 已明确致病
肌阵挛性癫痫伴破碎红纤维(MERRF)样综合征 部分TRAPPC11突变与线粒体功能障碍相关,可能参与MERRF样表型。 具有较强研究证据
肝病 TRAPPC11突变可能影响肝细胞自噬和囊泡运输,导致肝损伤。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肌肉 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 中等表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 内源性表达
HEK293 暂无可靠数据 内源性表达
C2C12 暂无可靠数据 肌细胞分化中表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1287+5G>T 剪接位点突变 罕见 导致外显子跳跃,蛋白截短,功能丧失
p.Gly835Arg 错义突变 罕见 可能影响蛋白折叠或稳定性,功能部分丧失
p.Arg120Trp 错义突变 罕见 可能影响蛋白相互作用,功能改变
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数致病突变导致蛋白功能丧失,如剪接位点突变导致截短蛋白。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006888 (ER to Golgi vesicle-mediated transport) • GO:0006914 (autophagy)
• GO:0005794 (Golgi apparatus) • GO:0005829 (cytosol)
• GO:0030126 (TRAPP complex)

相关通路

hsa04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum)
hsa04144 (Endocytosis)
hsa04140 (Autophagy - animal)

蛋白质功能简介

TRAPPC11蛋白是TRAPP复合物的核心亚基,参与囊泡运输和自噬。该蛋白包含一个N端的TRAPP结构域和一个C端的DUF729结构域,可能参与蛋白-蛋白相互作用。TRAPPC11在多种组织中表达,尤其在肌肉和脑中高表达。

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