TRAPPC2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TRAPPC2是内质网到高尔基体囊泡运输的关键蛋白,其突变导致脊椎骨骺发育不良。
基因信息卡
| 基因符号 | TRAPPC2 |
|---|---|
| 基因全名 | trafficking protein particle complex subunit 2 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | Xp22.2 |
| NCBI Gene ID | 7189 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7189 |
| Ensembl ID | ENSG00000196459 |
| UniProt ID | P0DI81 |
| OMIM ID | 300202 |
| HGNC ID | 23061 |
| 基因别名 | Sedlin, SEDL, TRS20, MGC111102 |
基因功能与研究简介
TRAPPC2基因编码TRAPP(运输蛋白颗粒)复合物的一个亚基,该复合物在细胞内囊泡运输中发挥关键作用,特别是在内质网到高尔基体的运输过程中。TRAPPC2蛋白参与膜融合和囊泡对接,对维持细胞正常功能至关重要。该基因突变可导致X连锁脊椎骨骺发育不良(SEDT),一种以脊柱和骨骺发育异常为特征的疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| X连锁脊椎骨骺发育不良 | TRAPPC2基因突变导致TRAPP复合物功能异常,影响软骨细胞和骨细胞的正常发育,导致脊柱和骨骺的发育不良。 | 已明确致病 |
| 其他骨骼发育异常 | 部分研究提示TRAPPC2突变可能与早发性骨关节炎等骨骼疾病相关,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 软骨 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.155+1G>A | 剪接位点突变 | 罕见 | 导致外显子跳跃,产生截短蛋白,功能丧失 |
| p.Arg86Trp | 错义突变 | 罕见 | 影响蛋白结构,可能损害TRAPP复合物组装,功能丧失 |
| p.Val130Met | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数TRAPPC2突变导致功能丧失,包括剪接位点突变和错义突变,影响蛋白表达或功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明TRAPPC2突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明TRAPPC2突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006886 (intracellular protein transport) | • GO:0005484 (SNAP receptor activity) |
| • GO:0031201 (SNARE complex) | • GO:0005794 (Golgi apparatus) |
相关通路
• hsa04130 (SNARE interactions in vesicular transport)
• hsa04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum)
蛋白质功能简介
TRAPPC2蛋白是TRAPP复合物的一个亚基,该复合物在囊泡运输中作为鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)激活Rab1,促进内质网到高尔基体的囊泡对接和融合。TRAPPC2蛋白包含一个长链脂肪酸延伸酶样结构域,可能参与脂质代谢或膜弯曲。该蛋白在多种组织中表达,尤其在软骨和骨中高表达,其功能异常与骨骼发育不良相关。
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