TRERF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TRERF1(转录调节因子1)是一种参与基因转录调控的蛋白质,其功能异常可能与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 TRERF1
基因全名 Transcriptional Regulating Factor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 2p13.2
NCBI Gene ID 55809 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55809
Ensembl ID ENSG00000115129
UniProt ID Q96PN7
OMIM ID 610322
HGNC ID 18255
基因别名 RAP80, C2orf4, dJ421O16.1

基因功能与研究简介

TRERF1(转录调节因子1)基因编码一种含有锌指结构的转录调节因子,参与基因表达的调控。该蛋白可能通过与DNA或其他蛋白质相互作用来调节转录过程。TRERF1在多种组织中表达,其功能异常可能与某些疾病相关,但具体机制仍在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 潜在关联:TRERF1(RAP80)参与DNA损伤修复,其功能缺失可能增加乳腺癌风险。 较强研究证据
前列腺癌 潜在关联:TRERF1可能通过调控雄激素受体信号通路影响前列腺癌进展。 潜在关联
卵巢癌 潜在关联:TRERF1在DNA修复中的作用可能影响卵巢癌的易感性。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
前列腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
卵巢 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF-7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
LNCaP 暂无可靠数据 前列腺癌细胞系
OVCAR-3 暂无可靠数据 卵巢癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质翻译起始,导致功能异常
c.2T>C (p.Met1Thr) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质翻译起始,导致功能异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变:导致TRERF1蛋白功能丧失或减弱,可能影响DNA损伤修复等过程。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明TRERF1存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:目前暂无明确证据表明TRERF1存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 DNA binding • GO:0005515 protein binding
• GO:0005634 nucleus • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated

相关通路

Homologous recombination repair of double-strand breaks (Reactome: R-HSA-5693532)
BRCA1-mediated DNA repair (Reactome: R-HSA-5693567)

蛋白质功能简介

TRERF1蛋白(UniProt Q96PN7)含有锌指结构,定位于细胞核,参与DNA损伤修复和转录调控。该蛋白与BRCA1相互作用,在DNA双链断裂的同源重组修复中发挥作用。TRERF1的异常表达或突变可能影响基因组稳定性,与肿瘤发生相关。

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