TRIM16基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TRIM16是一种E3泛素连接酶,参与自噬调控、炎症反应和细胞分化,与多种癌症及自身免疫性疾病相关。

基因信息卡

基因符号 TRIM16
基因全名 tripartite motif containing 16
基因类型 protein-coding gene
染色体位置 17p11.2
NCBI Gene ID 10626 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10626
Ensembl ID ENSG00000134853
UniProt ID O95390
OMIM ID 609790
HGNC ID 16299
基因别名 BBP, EBBP, TRIM16L

基因功能与研究简介

TRIM16(tripartite motif containing 16)属于TRIM蛋白家族,具有RING finger、B-box和coiled-coil结构域,并含有C端B30.2/SPRY结构域。TRIM16作为E3泛素连接酶,参与调控自噬、炎症反应、细胞分化和凋亡等过程。研究表明TRIM16在多种癌症中表达异常,并影响肿瘤发生发展。此外,TRIM16还参与调控角质形成细胞的分化,与皮肤病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 TRIM16在多种癌症中表达下调或上调,通过调控自噬、凋亡和细胞周期影响肿瘤进展。 较强研究证据
自身免疫性疾病 TRIM16参与炎症反应调控,可能影响自身免疫性疾病的发生。 潜在关联
皮肤病 TRIM16在角质形成细胞分化中发挥作用,可能参与银屑病等皮肤病。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.I41M) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能
c.456C>T (p.R152W) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变,导致TRIM16蛋白活性降低或丧失,可能影响自噬调控和肿瘤抑制功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,增强TRIM16的致癌或促炎活性,但具体机制尚不明确。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,突变蛋白干扰野生型TRIM16的功能,可能通过竞争底物或形成无功能二聚体实现。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity)
• GO:0006914 (autophagy) • GO:0006954 (inflammatory response)
• GO:0007399 (nervous system development)

相关通路

Autophagy pathway
Inflammatory response pathway

蛋白质功能简介

TRIM16蛋白由571个氨基酸组成,包含RING finger、B-box、coiled-coil和B30.2/SPRY结构域。作为E3泛素连接酶,TRIM16通过泛素化底物参与自噬调控、炎症信号转导和细胞分化。TRIM16在多种组织中表达,尤其在皮肤和免疫细胞中高表达。其亚细胞定位主要在细胞质和自噬体中。

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