TRIM23基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TRIM23是一种E3泛素连接酶,参与固有免疫、自噬调控及病毒感染过程,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 TRIM23
基因全名 tripartite motif containing 23
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q36.3
NCBI Gene ID 373 ncbi.nlm.nih.gov/gene/373
Ensembl ID ENSG00000066455
UniProt ID P36406
OMIM ID 602563
HGNC ID 684
基因别名 RNF46, ARFD1

基因功能与研究简介

TRIM23(tripartite motif containing 23)属于TRIM家族蛋白,具有E3泛素连接酶活性。该蛋白包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域,以及ADP-ribosylation factor(ARF)结构域。TRIM23在固有免疫应答中发挥重要作用,通过泛素化修饰调节NF-κB信号通路,并参与自噬调控。此外,TRIM23与多种病毒感染相关,如HIV-1和甲型流感病毒。研究表明,TRIM23的突变可能影响其功能,与某些疾病的发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
暂无明确疾病关联 暂无明确证据 暂无可靠数据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
暂无明确致病突变 暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无明确证据
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变(Loss of Function)可能导致TRIM23的E3泛素连接酶活性降低或丧失,影响其底物泛素化,进而干扰NF-κB信号通路和自噬过程。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变(Gain of Function)可能增强TRIM23的活性或改变其底物特异性,导致信号通路异常激活。目前尚无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变(Dominant Negative)可能产生截短或异常蛋白,干扰野生型TRIM23的功能,但具体机制尚不明确。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0005515 protein binding
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0005829 cytosol
• GO:0005654 nucleoplasm • GO:0007250 activation of NF-kappaB transcription factor activity
• GO:0006914 autophagy • GO:0045087 innate immune response

相关通路

NF-kappaB signaling pathway (KEGG: hsa04064)
Autophagy (KEGG: hsa04140)

蛋白质功能简介

TRIM23蛋白由574个氨基酸组成,分子量约64 kDa。其N端包含RING finger结构域(负责E3泛素连接酶活性)、B-box和coiled-coil结构域,C端包含ADP-ribosylation factor(ARF)结构域。TRIM23通过其RING结构域催化底物蛋白的泛素化,参与调控NF-κB信号通路和自噬。在病毒感染中,TRIM23可被病毒蛋白劫持,影响病毒复制。

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