TRIM23基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TRIM23是一种E3泛素连接酶,参与固有免疫、自噬调控及病毒感染过程,与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TRIM23 |
|---|---|
| 基因全名 | tripartite motif containing 23 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q36.3 |
| NCBI Gene ID | 373 ncbi.nlm.nih.gov/gene/373 |
| Ensembl ID | ENSG00000066455 |
| UniProt ID | P36406 |
| OMIM ID | 602563 |
| HGNC ID | 684 |
| 基因别名 | RNF46, ARFD1 |
基因功能与研究简介
TRIM23(tripartite motif containing 23)属于TRIM家族蛋白,具有E3泛素连接酶活性。该蛋白包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域,以及ADP-ribosylation factor(ARF)结构域。TRIM23在固有免疫应答中发挥重要作用,通过泛素化修饰调节NF-κB信号通路,并参与自噬调控。此外,TRIM23与多种病毒感染相关,如HIV-1和甲型流感病毒。研究表明,TRIM23的突变可能影响其功能,与某些疾病的发生发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 暂无明确疾病关联 | 暂无明确证据 | 暂无可靠数据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 暂无明确致病突变 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无明确证据 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变(Loss of Function)可能导致TRIM23的E3泛素连接酶活性降低或丧失,影响其底物泛素化,进而干扰NF-κB信号通路和自噬过程。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变(Gain of Function)可能增强TRIM23的活性或改变其底物特异性,导致信号通路异常激活。目前尚无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变(Dominant Negative)可能产生截短或异常蛋白,干扰野生型TRIM23的功能,但具体机制尚不明确。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0005829 cytosol |
| • GO:0005654 nucleoplasm | • GO:0007250 activation of NF-kappaB transcription factor activity |
| • GO:0006914 autophagy | • GO:0045087 innate immune response |
相关通路
• NF-kappaB signaling pathway (KEGG: hsa04064)
• Autophagy (KEGG: hsa04140)
蛋白质功能简介
TRIM23蛋白由574个氨基酸组成,分子量约64 kDa。其N端包含RING finger结构域(负责E3泛素连接酶活性)、B-box和coiled-coil结构域,C端包含ADP-ribosylation factor(ARF)结构域。TRIM23通过其RING结构域催化底物蛋白的泛素化,参与调控NF-κB信号通路和自噬。在病毒感染中,TRIM23可被病毒蛋白劫持,影响病毒复制。