TRIM37基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TRIM37基因编码E3泛素连接酶,参与多种细胞过程,其突变与多种疾病相关,是重要的药物研发靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | TRIM37 |
|---|---|
| 基因全名 | tripartite motif containing 37 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q22 |
| NCBI Gene ID | 4591 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4591 |
| Ensembl ID | ENSG00000104879 |
| UniProt ID | Q94972 |
| OMIM ID | 605427 |
| HGNC ID | 16234 |
| 基因别名 | MUL, POB1, TEF1 |
基因功能与研究简介
TRIM37基因编码一个属于TRIM家族(tripartite motif family)的E3泛素连接酶。该蛋白包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域,参与泛素-蛋白酶体途径,调控多种细胞过程,如细胞增殖、凋亡、DNA损伤修复和炎症反应。TRIM37在多种组织中表达,其异常表达或突变与多种疾病相关,包括癌症和遗传性疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | TRIM37在乳腺癌中高表达,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 卵巢癌 | TRIM37在卵巢癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控细胞周期和凋亡影响肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肝癌 | TRIM37在肝细胞癌中高表达,可能通过激活NF-κB通路促进肿瘤生长和转移。 | 研究证据 |
| 多发性骨髓瘤 | TRIM37在骨髓瘤细胞中高表达,可能通过调控p53通路影响肿瘤细胞存活。 | 研究证据 |
| MULIBREY侏儒症 | TRIM37基因突变导致MULIBREY侏儒症(Mulibrey nanism),这是一种常染色体隐性遗传病,表现为生长迟缓、特殊面容和心肌病。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 (乳腺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | TRIM37高表达 |
| HeLa (宫颈癌细胞系) | 暂无可靠数据 | TRIM37表达 |
| HepG2 (肝癌细胞系) | 暂无可靠数据 | TRIM37表达 |
| U2OS (骨肉瘤细胞系) | 暂无可靠数据 | TRIM37表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.493C>T (p.Arg165Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1186C>T (p.Arg396Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1468C>T (p.Arg490Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1516C>T (p.Arg506Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.1576C>T (p.Arg526Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如无义突变导致蛋白截短,失去E3泛素连接酶活性,影响底物降解,导致疾病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) |
| • GO:0008270 (zinc ion binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process) |
| • GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process) |
相关通路
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)
• NF-kappa B signaling pathway (KEGG: hsa04064)
蛋白质功能简介
TRIM37蛋白是E3泛素连接酶,属于TRIM家族。它包含RING finger结构域、B-box结构域和coiled-coil结构域,通过泛素-蛋白酶体途径降解底物蛋白,参与调控细胞增殖、凋亡、DNA损伤修复和炎症反应。TRIM37在多种肿瘤中高表达,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡促进肿瘤发生发展。此外,TRIM37基因突变可导致MULIBREY侏儒症,这是一种罕见的常染色体隐性遗传病。