TRIM46基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TRIM46编码E3泛素连接酶,参与微管动力学调控和神经元极性建立,与神经系统疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 TRIM46
基因全名 tripartite motif containing 46
基因类型 protein coding
染色体位置 1q22
NCBI Gene ID 80128 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80128
Ensembl ID ENSG00000163386
UniProt ID Q7Z4K8
OMIM ID 610248
HGNC ID 19012
基因别名 TRIM46, GENX-6554, RNF18

基因功能与研究简介

TRIM46(tripartite motif containing 46)属于TRIM蛋白家族,编码的蛋白质包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域,具有E3泛素连接酶活性。TRIM46在神经元中高表达,参与微管动力学调控和神经元极性建立,对轴突和树突的发育至关重要。此外,TRIM46还参与细胞增殖、凋亡和自噬等过程,与多种疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 TRIM46突变可能影响神经元极性,导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
癌症 TRIM46在多种癌症中表达异常,可能通过调控细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生发展。 具有较强研究证据
精神分裂症 TRIM46基因变异与精神分裂症风险相关,但机制未明。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响微管结合和神经元极性。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0008270 zinc ion binding
• GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005813 centrosome • GO:0005874 microtubule
• GO:0015630 microtubule cytoskeleton • GO:0030424 axon
• GO:0030425 dendrite • GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process

相关通路

Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
Microtubule cytoskeleton organization (GO:0000226)

蛋白质功能简介

TRIM46蛋白包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域,具有E3泛素连接酶活性。在神经元中,TRIM46与微管结合,调控微管动力学和极性,对轴突和树突的发育至关重要。此外,TRIM46还参与细胞周期调控和凋亡,其异常表达与多种癌症相关。

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