TRIM50基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TRIM50是E3泛素连接酶家族成员,参与蛋白质泛素化调控,与威廉姆斯综合征相关,并在多种癌症中表达异常。

基因信息卡

基因符号 TRIM50
基因全名 tripartite motif containing 50
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q11.23
NCBI Gene ID 135895 ncbi.nlm.nih.gov/gene/135895
Ensembl ID ENSG00000176454
UniProt ID Q86XT9
OMIM ID 612548
HGNC ID 19018
基因别名 RNF105, tripartite motif-containing protein 50

基因功能与研究简介

TRIM50基因编码三结构域蛋白家族成员,属于E3泛素连接酶,参与蛋白质泛素化修饰,调控多种细胞过程。该基因位于染色体7q11.23区域,该区域缺失与威廉姆斯综合征相关。TRIM50在多种组织中表达,尤其在睾丸和胎盘中高表达。研究表明TRIM50可能参与癌症发生发展,但其具体功能仍需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
威廉姆斯综合征 TRIM50位于7q11.23区域,该区域杂合缺失导致威廉姆斯综合征,但TRIM50单倍剂量不足的具体致病机制尚不明确。 OMIM
癌症 TRIM50在多种癌症中表达异常,可能通过调控泛素化影响肿瘤抑制因子或癌蛋白的稳定性,但具体机制尚在研究中。 COSMIC, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
胎盘 暂无可靠数据 暂无可靠数据
其他组织 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致TRIM50蛋白活性降低或丧失,影响其E3泛素连接酶功能,可能参与疾病发生。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强TRIM50的活性或稳定性,导致底物过度泛素化,可能促进肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常TRIM50蛋白的功能,导致泛素化通路异常。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity
• GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0005634 nucleus
• GO:0005737 cytoplasm

相关通路

Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)

蛋白质功能简介

TRIM50蛋白属于三结构域蛋白家族,包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域,具有E3泛素连接酶活性。它可能通过泛素化底物参与调控细胞增殖、凋亡等过程。在威廉姆斯综合征中,TRIM50的单倍剂量不足可能影响其功能,但具体底物和通路尚待阐明。

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