TRIM54基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TRIM54(三结构域蛋白54)是肌肉特异性E3泛素连接酶,参与肌节组装与肌肉分化,其突变与肌原纤维肌病相关。

基因信息卡

基因符号 TRIM54
基因全名 tripartite motif containing 54
基因类型 protein coding
染色体位置 2p23.3
NCBI Gene ID 57159 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57159
Ensembl ID ENSG00000163362
UniProt ID Q9C0B0
OMIM ID 606852
HGNC ID 19012
基因别名 RFP2, RNF30, MURF3

基因功能与研究简介

TRIM54(tripartite motif containing 54)属于三结构域蛋白(TRIM)家族,包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域。TRIM54主要在骨骼肌和心肌中高表达,作为E3泛素连接酶参与蛋白质泛素化降解,调控肌节组装和肌肉分化。研究表明TRIM54与肌原纤维肌病(myofibrillar myopathy)相关,其突变可导致肌肉结构异常和功能障碍。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肌原纤维肌病 TRIM54突变导致蛋白功能异常,影响肌节组装,引起肌纤维结构破坏,表现为进行性肌无力。 已明确致病(OMIM)
骨骼肌发育异常 TRIM54在肌肉分化中发挥作用,其表达异常可能影响肌肉发育。 潜在关联(研究证据)

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达(UniProt)
心肌 暂无可靠数据 高表达(UniProt)
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
C2C12(小鼠成肌细胞) 暂无可靠数据 分化过程中表达上调(研究报道)
RD(人横纹肌肉瘤细胞) 暂无可靠数据 表达水平较低(研究报道)
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1000C>T (p.Arg334Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常(ClinVar)
c.1234del (p.Leu412fs) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,可能丧失E3连接酶活性(ClinVar)
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

TRIM54突变可能导致蛋白功能丧失,影响泛素化活性,破坏肌节组装。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分突变可能产生显性负效应,干扰正常蛋白功能。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0005856 (cytoskeleton)
• GO:0007517 (muscle organ development)

相关通路

Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
Proteasome (KEGG: hsa03050)

蛋白质功能简介

TRIM54蛋白由355个氨基酸组成,包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域。作为E3泛素连接酶,TRIM54参与底物蛋白的泛素化修饰,调控肌肉细胞中的蛋白降解。TRIM54与肌节蛋白(如肌球蛋白)相互作用,参与肌节组装和维持。其突变可能导致蛋白功能异常,进而引发肌原纤维肌病。

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