TRIM55基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TRIM55(RING finger protein 55)是肌肉特异性的E3泛素连接酶,参与肌细胞分化与肌节组装,与肌肉发育和心肌病相关。

基因信息卡

基因符号 TRIM55
基因全名 tripartite motif containing 55
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q13.2
NCBI Gene ID 84675 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84675
Ensembl ID ENSG00000114544
UniProt ID Q9BYV6
OMIM ID 611417
HGNC ID 19033
基因别名 RFP2, RNF55, MURF2

基因功能与研究简介

TRIM55(tripartite motif containing 55)属于TRIM蛋白家族,包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域。该基因主要在骨骼肌和心肌中高表达,编码的蛋白质作为E3泛素连接酶参与肌细胞分化、肌节组装和肌肉蛋白降解的调控。TRIM55通过与肌联蛋白(titin)等相互作用,在肌肉发育和维持中发挥重要作用。研究表明TRIM55与心肌病和肌肉萎缩等疾病相关,但其具体致病机制仍在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
心肌病 TRIM55突变可能影响肌节组装和蛋白降解,导致心肌结构异常,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
肌肉萎缩 TRIM55参与泛素-蛋白酶体途径,可能调节肌肉蛋白降解,与肌肉萎缩相关。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
心肌 暂无可靠数据 高表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
C2C12 暂无可靠数据 小鼠成肌细胞,分化过程中表达上调
H9c2 暂无可靠数据 大鼠心肌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 暂无可靠数据 可能导致截短蛋白,功能丧失
c.456_458del (p.Lys152del) 缺失突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白结构,功能未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致TRIM55蛋白功能缺失或减弱,可能影响肌节组装和蛋白降解,与肌肉疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据表明TRIM55存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:可能干扰正常TRIM55功能,但暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity
• GO:0005737 cytoplasm • GO:0005859 muscle myosin complex
• GO:0007512 establishment of muscle cell polarity • GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process

相关通路

Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
Proteasome (KEGG: hsa03050)

蛋白质功能简介

TRIM55蛋白由493个氨基酸组成,包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域。作为E3泛素连接酶,TRIM55参与泛素-蛋白酶体途径,调控肌肉蛋白的降解。在肌细胞分化过程中,TRIM55表达上调,并与肌联蛋白(titin)相互作用,参与肌节的组装。TRIM55还可能与肌肉萎缩和心肌病的发病机制相关,但具体分子机制仍需进一步研究。

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