TRIM65基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TRIM65是一种E3泛素连接酶,参与调控先天免疫、炎症反应及肿瘤发生,是潜在的疾病治疗靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | TRIM65 |
|---|---|
| 基因全名 | tripartite motif containing 65 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 17q25.1 |
| NCBI Gene ID | 201292 ncbi.nlm.nih.gov/gene/201292 |
| Ensembl ID | ENSG00000141425 |
| UniProt ID | Q6PJ69 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:26942 |
| 基因别名 | FLJ32921 |
基因功能与研究简介
TRIM65(tripartite motif containing 65)属于TRIM蛋白家族,具有E3泛素连接酶活性。该基因位于染色体17q25.1,编码的蛋白质包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域。TRIM65参与调控先天免疫应答、炎症反应和细胞增殖,与多种肿瘤的发生发展相关。研究表明,TRIM65通过泛素化降解底物蛋白(如p53、IRF3等)来调节信号通路,从而影响疾病进程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | TRIM65在肝细胞癌中高表达,通过促进p53泛素化降解,抑制细胞凋亡,促进肿瘤增殖和转移。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | TRIM65在结直肠癌中表达上调,与不良预后相关,可能通过调控Wnt/β-catenin通路促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | TRIM65在非小细胞肺癌中高表达,与肿瘤分期和淋巴结转移相关,可能通过调控EMT促进侵袭。 | 较强研究证据 |
| 炎症性疾病 | TRIM65参与调控先天免疫,通过泛素化降解IRF3抑制I型干扰素产生,可能影响病毒感染和自身免疫疾病。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Cys) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白结构,功能未知 |
| c.456G>A (p.Trp152*) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | 导致截短蛋白,可能丧失E3连接酶活性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失型突变):导致TRIM65蛋白功能丧失或减弱,可能影响其底物泛素化,进而影响细胞增殖和免疫调节。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):增强TRIM65的E3连接酶活性或改变底物特异性,可能促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):突变蛋白干扰野生型TRIM65的功能,可能通过竞争底物或形成无功能二聚体实现。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) |
| • GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005829 (cytosol) | • GO:0045087 (innate immune response) |
| • GO:0006954 (inflammatory response) | • GO:0008283 (cell population proliferation) |
相关通路
• p53 signaling pathway (hsa04115)
• RIG-I-like receptor signaling pathway (hsa04622)
• Wnt signaling pathway (hsa04310)
蛋白质功能简介
TRIM65蛋白属于TRIM家族,包含RING finger、B-box和coiled-coil结构域,具有E3泛素连接酶活性。它通过泛素化降解底物蛋白(如p53、IRF3等)来调控细胞凋亡、先天免疫和炎症反应。在多种肿瘤中高表达,促进肿瘤增殖、侵袭和转移,是潜在的肿瘤治疗靶点。