TSEN2基因|tRNA剪接内切酶复合物亚基、功能、疾病关联与突变研究
TSEN2是tRNA剪接内切酶复合物的关键亚基,其突变与脑桥小脑发育不全2C型(PCH2C)相关,参与tRNA加工和RNA代谢。
基因信息卡
| 基因符号 | TSEN2 |
|---|---|
| 基因全名 | tRNA splicing endonuclease subunit 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p36.31 |
| NCBI Gene ID | 80746 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80746 |
| Ensembl ID | ENSG00000154743 |
| UniProt ID | Q8NCE0 |
| OMIM ID | 608753 |
| HGNC ID | 28473 |
| 基因别名 | SEN2, SEN2L, HsSen2 |
基因功能与研究简介
TSEN2基因编码tRNA剪接内切酶复合物的一个亚基,该复合物负责在真核生物中切除tRNA前体的内含子。TSEN2蛋白与TSEN15、TSEN34和TSEN54共同组成功能性内切酶复合物。该基因的突变与脑桥小脑发育不全2C型(PCH2C)相关,这是一种罕见的常染色体隐性遗传神经发育障碍,表现为小脑和脑干发育不全。TSEN2在tRNA加工和RNA代谢中发挥关键作用,其功能缺失可能导致tRNA剪接异常,进而影响神经元发育和功能。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 脑桥小脑发育不全2C型(Pontocerebellar Hypoplasia Type 2C, PCH2C) | TSEN2基因突变导致tRNA剪接内切酶复合物功能受损,影响tRNA成熟,进而导致神经元发育异常和神经退行性变。 | 已明确致病(OMIM, ClinVar) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据GTEx,但nTPM未提供) |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 广泛表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.926G>A (p.Arg309His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与PCH2C相关 |
| c.349A>G (p.Thr117Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与PCH2C相关 |
| c.118G>A (p.Gly40Ser) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与PCH2C相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
TSEN2突变导致蛋白功能丧失或降低,影响tRNA剪接内切酶复合物的活性,导致tRNA加工异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明TSEN2突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明TSEN2突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004519 (endonuclease activity) | • GO:0006388 (tRNA splicing |
| • via endonucleolytic cleavage and ligation) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) |
相关通路
• tRNA processing (Reactome: R-HSA-6782311)
蛋白质功能简介
TSEN2蛋白是tRNA剪接内切酶复合物的亚基之一,该复合物在细胞核中催化tRNA前体内含子的切除。TSEN2蛋白包含一个类核酸酶结构域,可能参与底物识别和催化。该蛋白与TSEN15、TSEN34和TSEN54相互作用,形成稳定的复合物。TSEN2的突变会导致复合物功能异常,进而影响tRNA成熟,最终导致神经发育障碍。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|