TSEN54基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

TSEN54是tRNA剪接内切酶复合体的关键亚基,其突变导致脑桥小脑发育不全2型和4型等神经发育障碍。

基因信息卡

基因符号 TSEN54
基因全名 tRNA splicing endonuclease subunit 54
基因类型 protein-coding
染色体位置 17q25.1
NCBI Gene ID 283989 ncbi.nlm.nih.gov/gene/283989
Ensembl ID ENSG00000182173
UniProt ID Q7Z6J9
OMIM ID 608755
HGNC ID 27561
基因别名 SEN54, tRNA-intron endonuclease 54 kDa subunit

基因功能与研究简介

TSEN54基因编码tRNA剪接内切酶复合体的54 kDa亚基,该复合体负责从tRNA前体中切除内含子。TSEN54在真核生物中高度保守,对tRNA成熟至关重要。TSEN54突变与脑桥小脑发育不全2型和4型(PCH2和PCH4)相关,这些疾病表现为严重的神经发育障碍,包括小脑和脑干发育不全。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
脑桥小脑发育不全2型 TSEN54突变导致tRNA剪接缺陷,影响神经元发育,导致小脑和脑桥萎缩。 已明确致病
脑桥小脑发育不全4型 TSEN54突变导致更严重的神经发育障碍,表现为出生前脑部异常。 已明确致病
其他神经发育障碍 部分TSEN54变异可能与非典型表型相关,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
其他组织 暂无可靠数据 广泛表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
神经干细胞 暂无可靠数据 高表达
HeLa 暂无可靠数据 中等表达
HEK293 暂无可靠数据 中等表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.919G>T (p.Ala307Ser) 错义突变 常见于PCH2 可能影响蛋白稳定性或复合体组装
c.1259A>G (p.Asp420Gly) 错义突变 罕见 可能影响催化活性
c.387+5G>A 剪接位点突变 罕见 可能导致异常剪接,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数致病突变导致功能丧失,影响tRNA剪接效率。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004519 (endonuclease activity) • GO:0006388 (tRNA splicing
• via endonucleolytic cleavage) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

tRNA splicing pathway (Reactome: R-HSA-6782311)

蛋白质功能简介

TSEN54蛋白是tRNA剪接内切酶复合体的亚基,该复合体由TSEN2、TSEN15、TSEN34和TSEN54组成。TSEN54可能参与复合体的组装或底物识别。其功能异常导致tRNA前体加工缺陷,进而影响蛋白质合成,尤其在快速分裂的神经细胞中表现明显。

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