TSHZ1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TSHZ1是调控发育的关键转录因子,其突变与先天性耳聋和甲状腺发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TSHZ1 |
|---|---|
| 基因全名 | teashirt zinc finger homeobox 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 18q22.3 |
| NCBI Gene ID | 10116 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10116 |
| Ensembl ID | ENSG00000134352 |
| UniProt ID | Q6ZSZ5 |
| OMIM ID | 614427 |
| HGNC ID | 30462 |
| 基因别名 | TSH1, TSHZ1, ZNF449 |
基因功能与研究简介
TSHZ1基因编码一种含有锌指结构域和同源异型盒的转录因子,属于teashirt锌指家族。该蛋白在胚胎发育中发挥重要作用,参与调控多个器官的形态发生,包括内耳、甲状腺和骨骼等。TSHZ1的突变与先天性耳聋和甲状腺发育异常相关,其功能异常可能导致发育缺陷。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性耳聋 | TSHZ1突变导致内耳发育异常,引起感音神经性耳聋。 | 已明确致病 |
| 甲状腺发育异常 | TSHZ1突变影响甲状腺发育,可能导致甲状腺功能减退。 | 已明确致病 |
| 其他发育异常 | TSHZ1可能参与其他器官发育,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 内耳 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.100C>T (p.Arg34Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.200del (p.Leu67fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.300G>A (p.Trp100Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):突变导致蛋白功能丧失,如无义突变或移码突变产生截短蛋白,影响转录调控功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明TSHZ1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明TSHZ1突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003677 DNA binding | • GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006355 regulation of transcription |
| • DNA-templated | • GO:0007275 multicellular organism development |
相关通路
• 暂无明确Pathway ID
蛋白质功能简介
TSHZ1蛋白包含锌指结构域和同源异型盒,属于转录因子家族。它通过与DNA结合调控下游基因表达,参与胚胎发育中的模式形成和器官发生。在耳蜗和甲状腺发育中起关键作用,其突变导致这些器官的发育异常。