TSNAX基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TSNAX(Translin-associated protein X)是参与RNA干扰和DNA损伤修复的重要调控因子,与多种癌症和神经系统疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TSNAX |
|---|---|
| 基因全名 | Translin-associated protein X |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1q42.2 |
| NCBI Gene ID | 7257 ncbi.nlm.nih.gov/gene/7257 |
| Ensembl ID | ENSG00000143106 |
| UniProt ID | Q99598 |
| OMIM ID | 602746 |
| HGNC ID | 12371 |
| 基因别名 | TRAX |
基因功能与研究简介
TSNAX基因编码Translin-associated protein X(TRAX),是Translin(TSN)的相互作用蛋白。TRAX与Translin形成复合物,参与RNA干扰(RNAi)和DNA损伤修复。TRAX具有核酸酶活性,在微RNA(miRNA)加工和DNA双链断裂修复中发挥作用。此外,TRAX还参与调控基因表达和细胞增殖。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 精神分裂症 | TSNAX与DISC1基因相邻,可能影响神经发育和信号传导,与精神分裂症风险相关。 | 较强研究证据 |
| 双相情感障碍 | TSNAX基因变异可能影响情绪调节相关通路,与双相情感障碍关联。 | 潜在关联 |
| 癌症 | TSNAX在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响DNA修复和miRNA加工参与肿瘤发生。 | 癌症相关 |
| 智力障碍 | TSNAX基因突变可能影响神经发育,与智力障碍相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs2292813 | SNP | 未知 | 可能影响剪接或表达 |
| rs766288 | SNP | 未知 | 可能影响调控区域 |
| rs11122119 | SNP | 未知 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致TRAX蛋白活性降低或缺失,可能影响RNAi和DNA修复,与疾病风险增加相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:目前暂无明确证据表明TSNAX存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负效突变:目前暂无明确证据表明TSNAX存在显性负效突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003676 (nucleic acid binding) | • GO:0004519 (endonuclease activity) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0006302 (double-strand break repair) | • GO:0031053 (primary miRNA processing) |
相关通路
• RNA interference (RNAi) pathway
• DNA double-strand break repair pathway
• MicroRNA biogenesis pathway
蛋白质功能简介
TRAX蛋白由TSNAX基因编码,包含一个核酸酶结构域,与Translin形成复合物。TRAX在细胞核和细胞质中均有分布,参与miRNA加工和DNA损伤修复。TRAX的核酸酶活性对于miRNA前体的切割至关重要,同时也在DNA双链断裂修复中发挥作用。此外,TRAX可能参与调控基因表达和细胞周期。
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