TSPAN13基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
TSPAN13(四跨膜蛋白13)是四跨膜蛋白家族成员,参与细胞信号转导、肿瘤进展及免疫调节,在多种癌症中异常表达。
基因信息卡
| 基因符号 | TSPAN13 |
|---|---|
| 基因全名 | tetraspanin 13 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7p21.1 |
| NCBI Gene ID | 27075 ncbi.nlm.nih.gov/gene/27075 |
| Ensembl ID | ENSG00000106537 |
| UniProt ID | O95857 |
| OMIM ID | 608147 |
| HGNC ID | 17745 |
| 基因别名 | NET-6, TM4SF13 |
基因功能与研究简介
TSPAN13(四跨膜蛋白13)属于四跨膜蛋白超家族,该家族成员参与细胞粘附、迁移、信号转导及肿瘤进展。TSPAN13在多种组织中表达,尤其在免疫细胞和肿瘤细胞中具有重要功能。研究表明,TSPAN13在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤标志物或治疗靶点。此外,TSPAN13还参与免疫调节和细胞增殖。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 前列腺癌 | TSPAN13在前列腺癌中高表达,可能促进肿瘤进展和转移。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | TSPAN13在乳腺癌中表达上调,与不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | TSPAN13在非小细胞肺癌中表达升高,可能参与肿瘤侵袭。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | TSPAN13在结直肠癌中表达异常,可能影响细胞增殖。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| PC3(前列腺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | TSPAN13高表达 |
| MCF7(乳腺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | TSPAN13中等表达 |
| A549(肺癌细胞系) | 暂无可靠数据 | TSPAN13表达上调 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Ser41Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但临床意义未明 |
| c.456G>A (p.Thr152Thr) | 同义突变 | 低频 | 无功能影响 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明TSPAN13存在致病性功能缺失突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
TSPAN13在多种癌症中高表达,可能通过促进细胞增殖和迁移发挥功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明TSPAN13存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0005887 (integral component of plasma membrane) |
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0007155 (cell adhesion) |
| • GO:0008284 (positive regulation of cell population proliferation) |
相关通路
• hsa04510 (Focal adhesion)
• hsa04810 (Regulation of actin cytoskeleton)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
TSPAN13蛋白属于四跨膜蛋白家族,包含四个跨膜结构域和两个胞外环。该蛋白定位于细胞膜,参与细胞粘附、迁移和信号转导。TSPAN13在多种肿瘤中高表达,可能通过调节细胞增殖和凋亡影响肿瘤进展。此外,TSPAN13还参与免疫细胞功能调节。