TSR2基因|核糖体生物发生、疾病关联、突变与功能研究

TSR2是核糖体小亚基成熟的关键因子,其突变与骨髓衰竭和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 TSR2
基因全名 TSR2, 20S rRNA accumulation, homolog (S. cerevisiae)
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xp11.22
NCBI Gene ID 90121 ncbi.nlm.nih.gov/gene/90121
Ensembl ID ENSG00000156510
UniProt ID Q969E8
OMIM ID 300945
HGNC ID 25456
基因别名 DKFZp564A033

基因功能与研究简介

TSR2基因编码核糖体生物发生因子,参与核糖体小亚基(40S)的成熟过程。TSR2蛋白与核糖体RNA加工和核糖体组装相关,其功能障碍可导致核糖体病和癌症。TSR2位于X染色体,其突变与Diamond-Blackfan贫血(DBA)和5q-综合征相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Diamond-Blackfan贫血 TSR2突变导致核糖体生物发生缺陷,影响红细胞生成,导致DBA。 已明确致病
5q-综合征 TSR2位于5q染色体缺失区域,缺失导致单倍剂量不足,与骨髓增生异常综合征相关。 已明确致病
癌症 TSR2表达异常与多种癌症相关,可能通过影响核糖体功能促进肿瘤发生。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达
脾脏 暂无可靠数据 中等表达
胸腺 暂无可靠数据 中等表达
其他组织 暂无可靠数据 广泛表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1?) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.2T>C (p.Met1?) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.3G>A (p.Met1?) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

TSR2突变导致功能丧失,影响核糖体生物发生,导致DBA和5q-综合征。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006364 rRNA processing • GO:0005730 nucleolus
• GO:0003723 RNA binding • GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA
• 5.8S rRNA • LSU-rRNA)

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
rRNA processing (Reactome: R-HSA-72312)

蛋白质功能简介

TSR2蛋白是核糖体生物发生因子,参与40S核糖体亚基的成熟。它可能作为RNA结合蛋白,参与18S rRNA的加工和核糖体组装。TSR2的突变导致核糖体功能缺陷,影响蛋白质合成,进而导致疾病。

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