TSSC4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TSSC4(Tumor Suppressing Subtransfer Candidate 4)是一种与肿瘤抑制相关的基因,参与细胞增殖调控,其表达异常与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TSSC4 |
|---|---|
| 基因全名 | tumor suppressing subtransfer candidate 4 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11p15.5 |
| NCBI Gene ID | 10058 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10058 |
| Ensembl ID | ENSG00000167772 |
| UniProt ID | Q9Y5Q9 |
| OMIM ID | 604117 |
| HGNC ID | 11973 |
| 基因别名 | TSSC4, PPP1R37 |
基因功能与研究简介
TSSC4(Tumor Suppressing Subtransfer Candidate 4)位于染色体11p15.5,该区域在多种肿瘤中频繁发生杂合性缺失(LOH),提示其可能作为肿瘤抑制基因。TSSC4编码的蛋白含有磷酸酶1结合基序,可能参与细胞周期调控和增殖抑制。研究表明,TSSC4在多种癌症中表达下调,其过表达可抑制细胞增殖,提示其具有肿瘤抑制功能。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | TSSC4表达下调与肝细胞癌的进展相关,可能通过调控细胞增殖和凋亡参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | TSSC4在乳腺癌中表达降低,其低表达与不良预后相关,可能作为潜在的抑癌基因。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | TSSC4在结直肠癌中表达下调,可能通过影响Wnt信号通路参与肿瘤发生。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.IVS2+1G>A | 剪接位点突变 | 罕见 | 可能导致剪接异常,产生截短蛋白,功能丧失 |
| c.343C>T (p.Arg115*) | 无义突变 | 罕见 | 提前终止密码子,导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型突变):导致TSSC4蛋白表达减少或功能缺失,可能促进细胞增殖和肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明TSSC4存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明TSSC4存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0008283 (cell population proliferation) |
相关通路
• hsa04110 (Cell cycle)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
TSSC4蛋白由369个氨基酸组成,含有磷酸酶1结合基序,可能通过与蛋白磷酸酶1(PP1)相互作用参与细胞周期调控。研究表明,TSSC4过表达可抑制细胞增殖,并诱导细胞凋亡,提示其作为肿瘤抑制因子的潜在功能。