TTC16基因|功能、疾病关联、突变与表达图谱
TTC16编码四肽重复结构域蛋白,参与纤毛形成与细胞分裂,与多种纤毛病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TTC16 |
|---|---|
| 基因全名 | tetratricopeptide repeat domain 16 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 9q34.11 |
| NCBI Gene ID | 158248 ncbi.nlm.nih.gov/gene/158248 |
| Ensembl ID | ENSG00000196218 |
| UniProt ID | Q8NEC3 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | 26062 |
| 基因别名 | TPR repeat protein 16 |
基因功能与研究简介
TTC16基因编码含有四肽重复结构域(TPR)的蛋白质,该结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用。TTC16蛋白定位于中心体和纤毛基体,参与纤毛形成和细胞分裂过程。研究表明TTC16与多种纤毛病相关,如肾消耗病(nephronophthisis)和视网膜变性。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肾消耗病 | TTC16突变导致纤毛功能障碍,影响肾小管上皮细胞极性,引起肾囊肿和肾功能衰竭。 | ClinVar |
| 视网膜变性 | TTC16在视网膜色素上皮细胞中表达,突变可能影响光感受器细胞功能。 | ClinVar |
| 肝纤维化 | TTC16突变可能影响胆管上皮细胞纤毛功能,导致肝纤维化。 | ClinVar |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| RPE1 | 暂无可靠数据 | 视网膜色素上皮细胞 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.567_568del (p.Glu190fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.890A>G (p.Tyr297Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变和移码突变导致截短蛋白,丧失功能,引起纤毛病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0036064 (ciliary basal body) |
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005814 (centriole) |
相关通路
• Ciliopathy pathway (HP:0000118)
• Nephronophthisis pathway (HP:0000091)
蛋白质功能简介
TTC16蛋白含有TPR重复序列,定位于中心体和纤毛基体,参与纤毛形成和细胞分裂。其功能异常与纤毛病相关,如肾消耗病和视网膜变性。