TTC21B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
TTC21B编码纤毛相关蛋白,参与初级纤毛形成与功能,其突变与肾消耗病、肝纤维化等纤毛病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | TTC21B |
|---|---|
| 基因全名 | Tetratricopeptide Repeat Domain 21B |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q24.3 |
| NCBI Gene ID | 79809 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79809 |
| Ensembl ID | ENSG00000123607 |
| UniProt ID | Q7Z4L5 |
| OMIM ID | 612014 |
| HGNC ID | 25606 |
| 基因别名 | ATD4, IFT139, SRTD4 |
基因功能与研究简介
TTC21B基因编码四肽重复结构域蛋白21B,是IFT-A复合物的组成部分,参与初级纤毛的逆向运输。该基因突变可导致多种纤毛病,包括肾消耗病、Joubert综合征、Meckel综合征等。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肾消耗病 | TTC21B突变导致纤毛功能异常,影响肾小管发育,引起肾消耗病。 | ClinVar, OMIM |
| Joubert综合征 | TTC21B突变与Joubert综合征相关,表现为小脑蚓部发育不良等。 | OMIM |
| Meckel综合征 | TTC21B突变可导致Meckel综合征,表现为多囊肾、脑膨出等。 | OMIM |
| 肝纤维化 | TTC21B突变可能影响胆管细胞纤毛,导致肝纤维化。 | 研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| 肾上皮细胞 | 暂无可靠数据 | 纤毛相关 |
| 成纤维细胞 | 暂无可靠数据 | 纤毛相关 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.626G>A (p.Arg209His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1096C>T (p.Arg366Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
| c.2195_2196del (p.Leu732ArgfsTer3) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
多数TTC21B突变为功能丧失型,导致IFT-A复合物功能异常,影响纤毛逆向运输。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005929 (cilium) |
| • GO:0030992 (intraciliary transport particle A) | • GO:0035729 (intraciliary transport involved in cilium assembly) |
相关通路
• Cilium Assembly (GO:0060271)
• Hedgehog signaling pathway (GO:0007224)
蛋白质功能简介
TTC21B蛋白包含多个四肽重复结构域,是IFT-A复合物的核心成分,参与初级纤毛的逆向运输。该蛋白在纤毛形成和功能维持中起关键作用,其突变导致纤毛功能障碍,进而引发多种纤毛病。